ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

நாவல் சிட்ரஸ் தொழுநோய் வைரஸ் சைட்டோபிளாஸ்மிக் வகை 2 கண்டுபிடிப்பு பற்றிய ஒரு வழக்கு ஆய்வு சிறிய RNA நூலகங்களை அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை மற்றும் உயிர் தகவல் பகுப்பாய்வு மூலம் பயன்படுத்துதல்

அவிஜித் ராய், ஜொனாதன் ஷாவோ, ஜான் எஸ் ஹார்டுங், வில்லியம் ஷ்னீடர் மற்றும் ஆர்.எச்.பிர்லான்ஸ்கி

"அடுத்த தலைமுறை" வரிசைமுறை (NGS) என குறிப்பிடப்படும் புதுமையான வரிசைமுறை தொழில்நுட்பத்தின் வருகை, 'தெரியாத' மற்றும் 'தெரியாத' வைரஸ் நோய்க்கிருமிகளை முன்னோடி அறிவு இல்லாமல் அடையாளம் காண ஒரு புதிய அணுகுமுறையை வழங்குகிறது. தாவர வைரஸ்களின் மரபணுக்கள் பாதிக்கப்பட்ட ஹோஸ்டில் மிகக் குறைந்த டைட்டர்களில் நிகழும்போது கூட விரைவாகத் தீர்மானிக்க முடியும். ஆர்என்ஏ சைலன்சிங் ஹோஸ்ட் டிஃபென்ஸ் மூலம் உற்பத்தி செய்யப்படும் 18-35 நியூக்ளியோடைடுகள் நீளமுள்ள சிறிய ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் மக்கள்தொகையின் பாரிய இணையான வரிசைமுறையை இந்த முறை அடிப்படையாகக் கொண்டது. வேதியியல் மேம்பாடுகள், பயோ-இன்ஃபர்மேடிக் கருவிகள் மற்றும் பொறியியலில் ஏற்பட்ட முன்னேற்றங்கள் NGS இன் செலவுகளைக் குறைத்து, அதன் அணுகலை அதிகரிக்கச் செய்தன, மேலும் தாவர வைராலஜி துறையில் அதன் பயன்பாட்டை செயல்படுத்தின. இந்த மதிப்பாய்வில், புதிய சைட்டோபிளாஸ்மிக் சிட்ரஸ் லெப்ரோஸிஸ் வைரஸை (CiLV) கண்டுபிடிப்பதற்கான மூலக்கூறு உயிரியல் மற்றும் உயிர் தகவல் கருவிகளின் பயன்பாடுகளுடன் இணைந்து Illumina GA IIX இயங்குதளத்தைப் பயன்படுத்துவதைப் பற்றி விவாதிக்கிறோம். இந்த புதிய வைரஸ் CiLV இன் பொதுவான அறிகுறிகளை உருவாக்கியது, ஆனால் முன்னர் விவரிக்கப்பட்ட வைரஸிற்கான serological அல்லது PCR அடிப்படையிலான மதிப்பீடுகள் மூலம் கண்டறியப்படவில்லை. முழுமையற்ற மரபணு வளங்களைக் கொண்ட ஒரு முக்கியமான தோட்டக்கலைப் பயிரான இனிப்பு ஆரஞ்சு (சிட்ரஸ் சினென்சிஸ்) இல் குறைந்த டைட்டரில் புதிய வைரஸ் மரபணுவும் இருந்தது. தோட்டக்கலை ஆராய்ச்சியில் இது ஒரு பொதுவான சூழ்நிலை மற்றும் இந்த அணுகுமுறையின் பரந்த பயன்பாட்டுக்கு ஒரு எடுத்துக்காட்டு. நாவல் வைரஸ்களின் கண்டுபிடிப்புடன் கூடுதலாக, வைரஸ் பரிணாமம் மற்றும் சூழலியல் பற்றிய ஆய்வுகள் மற்றும் வைரஸ் மற்றும் ஹோஸ்ட் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களுக்கு இடையிலான தொடர்புகளுக்கு வரிசை தரவு பயனுள்ளதாக இருக்கும்.