ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

GMO மற்றும் GMO அல்லாத சோயாபீனிலிருந்து விதையில் உள்ள புரதம் மற்றும் பீனாலிக் கலவைகளின் ஒப்பீடு

சாவித்திரி எஸ் நடராஜன்*, ஃபரூக் எச் கான், தாவானந்த் எல் லுத்ரியா, மார்க் எல் டக்கர், கிஜியன் பாடல், வெஸ்லி எம் காரெட்

சோயாபீன் புரதம் மனித மற்றும் விலங்கு உணவுகளில் மதிப்புமிக்க மற்றும் முக்கிய அங்கமாகும். அமெரிக்காவில் பயிரிடப்படும் சோயாபீனில் ஏறத்தாழ 94% தரம் மற்றும் உற்பத்தித்திறனை அதிகரிக்க மரபணு மாற்றப்பட்டது (GM). மரபணு மாற்றத்தால் மதிப்பு கூட்டப்பட்ட பண்புகள் தொடர்ந்து உருவாக்கப்பட்டு வருவதால், GM சோயாபீன் விதைகளில் ஏதேனும் எதிர்பாராத மாற்றங்கள் ஏற்படுகிறதா என்பதைத் தீர்மானிக்க வேண்டியது அவசியம். இந்த விசாரணையில், களைக்கொல்லி-எதிர்ப்பு தேர்ந்தெடுக்கக்கூடிய மரபணு (பார்) மற்றும் β-குளுகுரோனிடேஸ் (GUS) நிருபர் ஆகியவற்றிற்கான மரபணுக்களை உள்ளடக்கிய ஒரு அக்ரோபாக்டீரியம் tumefaciens T-DNA செருகலுடன் நிகழ்வு 1,2 மற்றும் 3 ஐக் குறிக்கும் மூன்று வெவ்வேறு மரபணு மாற்றக் கோடுகளைத் தேர்ந்தெடுத்துள்ளோம். இரட்டை 35S காலிஃபிளவர் மொசைக் வைரஸ் (CaMV) ஊக்குவிப்பாளரைப் பயன்படுத்தி வெளிப்படுத்தப்படும் மரபணு மற்றும் முறையே சோயாபீன் பாலிகலக்டுரோனேஸ் (கிளைமா12ஜி01480) ஊக்குவிப்பான். டிரான்ஸ்ஜெனிக் கோடுகள் மற்றும் மாற்றப்படாதவை ப்ரோஜெனிட்டர் ஐசோலின் (கட்டுப்பாடு) புரோட்டியோமிக் மற்றும் பினாலிக் கலவை பகுப்பாய்வு இரண்டிற்கும் பயன்படுத்தப்பட்டது. விதை புரதங்கள் இரு பரிமாண பாலிஅக்ரிலாமைடு ஜெல் எலக்ட்ரோபோரேசிஸ் (2D-PAGE) மூலம் பிரிக்கப்பட்டது. ஒரு புரதச் சாற்றில் கண்டறியப்பட்ட சுமார் 1300 புரதப் புள்ளிகளில், 30 புள்ளிகள், கட்டுப்பாடு மற்றும் மூன்று நிகழ்வுகளுக்கான புரோட்டீன் ஜெல்களில் அவற்றின் ஒப்பீட்டளவில் ஏராளமாக உள்ள மென்பொருள்-நிர்ணயித்த வேறுபாடுகளின் (ANOVA) அடிப்படையில் மேலும் பகுப்பாய்வுக்காக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன. போன்ஃபெரோனி திருத்தத்திற்குப் பிறகு அடுத்தடுத்த புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வு முப்பது புரதப் புள்ளிகளில் இரண்டின் மிகுதியானது 1% நிகழ்தகவு மட்டத்தில் கணிசமாக வேறுபட்டது என்பதைக் குறிக்கிறது. இரண்டு புரதப் புள்ளிகள், ஒரு ஐசோஃப்ளேவோன் ரிடக்டேஸ் மற்றும் ஒரு குயினைன் ஆக்சிடோரேடக்டேஸ் போன்ற புரதம், நிகழ்வு 2 ஆகியவை கட்டுப்பாடு மற்றும் மற்ற இரண்டு டிரான்ஸ்ஜெனிக் நிகழ்வுகளிலிருந்து கணிசமாக வேறுபடுகின்றன. முப்பது புரதப் புள்ளிகளும் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி (எம்எஸ்) மூலம் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டு அடையாளம் காணப்பட்டன, அதைத் தொடர்ந்து மஸ்காட்டைப் பயன்படுத்தி என்சிபிஐ தரவுத்தளங்களைத் தேடியது. தேடுபொறி. புரதத்துடன் கூடுதலாக, இரண்டு வகை பினாலிக் கலவைகள், ஐசோஃப்ளவனாய்டுகள் மற்றும் பினாலிக் அமிலங்கள், LC-MS ஆல் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன. கட்டுப்பாட்டில் உள்ள பினோலிக் கலவைகள் அல்லது மூன்று டிரான்ஸ்ஜெனிக் நிகழ்வுகளுக்கான அளவு அல்லது சுயவிவரத்தில் முறையான வேறுபாடுகள் எதுவும் இல்லை என்று முடிவுகள் குறிப்பிடுகின்றன.