ஜர்னல் ஆஃப் பாக்டீரியாலஜி & பாராசிட்டாலஜி

சுருக்கம்

ஜெனஸ் மைக்கோபாக்டீரியம் மக்கள்தொகை அமைப்புக்கான ஒரு புதிய முன்னுதாரணம்

பால் ஜெஃப்ரி ஃப்ரீட்லின்

மைக்கோபாக்டீரியம் பேரினத்தில் காசநோய் மற்றும் தொழுநோய் ஆகிய நோய்க்கிருமி இனங்கள் உள்ளன, மேலும் குறைந்தபட்சம் 148 சில நேரங்களில் சந்தர்ப்பவாத நோய்க்கிருமி இனங்கள் சுற்றுச்சூழலை ஆக்கிரமிக்கின்றன. மைக்கோபாக்டீரியம், ஆக்டினோமைசீட்கள் வரிசையில், மற்ற அமில-வேக வகைகளின் செல் சுவர்களில் உள்ள மைக்கோலிக் அமிலங்களான கோரினேபாக்டீரியம், நோகார்டியா மற்றும் ரோடோகாக்கஸ் போன்றவற்றுடன் உள்ளது. DNA-சார்ந்த RNA பாலிமரேஸ் சப்யூனிட் b மரபணு rpoB, இந்த பாக்டீரியாக்களிடையே ஒப்பீட்டளவில் பாதுகாக்கப்படுகிறது. rpoB இன் 342bp துண்டில் உள்ள வரிசை பாலிமார்பிஸம் மைக்கோபாக்டீரியத்தின் பெரும்பாலான இனங்களை வேறுபடுத்த போதுமானது. எவ்வாறாயினும், இந்த பாலிமார்பிஸத்தை அடிப்படையாகக் கொண்ட ஒரு வலுவான மற்றும் சோதிக்கக்கூடிய பைலோஜெனி அல்லது மக்கள்தொகை கட்டமைப்பை உருவாக்குவது அல்லது பிற மரபணு பகுதிகளில் பாலிமார்பிஸம் என்பது மழுப்பலாகவே உள்ளது. இந்த ஆய்வு மைக்கோபாக்டீரியம் மக்கள்தொகை கட்டமைப்பின் இனத்தின் தீர்மானத்திற்கான ஒரு புதிய முன்னுதாரணத்தை முன்வைக்கிறது. 47 மைக்கோபாக்டீரியம் இனங்களுக்கான ஜென்பேங்க் தரவுகளிலிருந்து பெறப்பட்ட 342bp rpoB துண்டில், 5 நொதிகளுக்கான சிலிகோவில் கண்டறியப்பட்ட கட்டுப்பாட்டு நொதி தள பாலிமார்பிஸங்களில் குறைந்தபட்ச பரவலான மரம் (MST) கட்டப்பட்டது. MST அனுபவ ரீதியாக 3 பகுதிகளாக பிரிக்கப்பட்டது. மெதுவாக வளரும் மைக்கோபாக்டீரியாவின் (SGM) ஒளிவட்டத்துடன் கூடிய வேகமாக வளர்ந்து வரும் அனைத்து மைக்கோபாக்டீரியாக்களும் (RGM) MST-மண்டலம் 1 இல் கண்டறியப்பட்டன. மைக்கோபாக்டீரியம் மக்கள்தொகைக் குழுவின் MST-மண்டல மாதிரியின் சரியான தன்மை, குறிப்பிட்ட சிலவற்றின் இணைப்புச் சமநிலையின்மையால் உறுதிப்படுத்தப்பட்டது. கட்டுப்பாடு தள அல்லீல்கள். சில அல்லீல்களுக்கு, MST-மண்டலம் 1 இல் உள்ள SGM ஆனது MST-மண்டலத்தின் SGM 3 ஐ விட MST-மண்டல 1 இன் RGM ஐ ஒத்திருந்தது. இந்த மாதிரியானது வெளியிடப்பட்ட மரபணு மற்றும் பினோடிபிக் அவதானிப்புகளுடன் ஒத்துப்போகும் கட்டமைப்பை வழங்கியது, இதில் ஒப்பீட்டு மரபியல் மற்றும் ரைபோசோமால் ஆர்என்ஏ (ஆர்என்ஏ) ஆகியவை அடங்கும். rRNA) மரபணு பண்புகள் இனங்களுக்கிடையில் விநியோகம், மற்றும் இனங்களின் கிளாடிஸ்டிக் குழுக்களைப் புகாரளித்தது. கோரினேபாக்டீரியம் டிப்தீரியா, நோகார்டியா நோவா மற்றும் ரோடோகாக்கஸ் ஈக்வி ஆகியவை முறையே MSTregions 2, 3 மற்றும் 1ஐச் சேர்ந்தவை. முடிவில், மைக்கோபாக்டீரியம் மக்கள்தொகைக் கட்டமைப்பின் MST-மண்டல மாதிரியானது வலுவானது, தெளிவற்றது, அல்லீல்களுக்கு வெளிப்படையானது, மரபணு வகைகள் மற்றும் பினோடைப்களுடன் ஒத்துப்போகும் மற்றும் புள்ளிவிவர ரீதியாக சோதிக்கக்கூடியதாக இருந்தது.