பயோமோலிகுலர் ரிசர்ச் & தெரபியூட்டிக்ஸ் ஜர்னல்

சுருக்கம்

[ 11 Ψ 12 (CN 4 )]ScyII மற்றும் [ 15 Ψ 16 (CN 4 )]ScyII– 2டி என்எம்ஆர் ஸ்பெக்ட்ரோஸ்கோபி மற்றும் கோட்பாட்டு முறைகள் மூலம் இரண்டு சைலியோரினின் II ஒப்புமைகளின் இணக்க ஆய்வுகள்

கிரிஸ்டோஃப் ப்ர்ஸோசோவ்ஸ்கி, எமிலியா சிகோர்ஸ்கா, ஹன்னா மிக்ஸ்னிகோவ்ஸ்கா, கதர்சினா கோனெக்கோ, ரஃபாஸ் ஆஸ்லுசார்ஸ், ஜோலாண்டா குமிர்ஸ்கா, விட்டோல்ட் மோஸ்கா, ஜேசெக் ஓல்சாக், ஜானுஸ் ஜப்ரோக்கி, சில்வியா ரோம்டோவ்ஸ்- Zbigniew KaczyÅ„ski

Scyliorhinin II [11Ψ12(CN4])]ScyII மற்றும் [15Ψ16(CN4)]ScyII இன் இரண்டு ஒப்புமைகளின் இணக்க பகுப்பாய்வு DMSO-d6 இல் செய்யப்பட்டது. 2டி என்எம்ஆர் நுட்பங்கள் மற்றும் கட்டுப்படுத்தப்பட்ட மூலக்கூறு இயக்கவியல் பயன்படுத்தப்பட்டது. எங்கள் முந்தைய ஆய்வுகள் Scyliorhinin II DMSO-d6 கரைசலில் மூன்று சிஸ் பெப்டைட் பிணைப்புகளை ஏற்றுக்கொள்வதைக் காட்டியது. மேலும், அதன் இரண்டு ஒப்புமைகளில் [Aib16] ScyII மற்றும் [Sar16] ScyII, நாங்கள் cis பெப்டைட் பிணைப்பு வடிவவியலைக் கண்டறிந்தோம். மேலே கருத்தில் கொண்டு, கட்டுப்படுத்தப்பட்ட ScyII ஒப்புமைகளின் விரிவான இணக்க ஆய்வுகளை மேற்கொள்ள முடிவு செய்தோம். அவ்வாறு செய்ய, ஆய்வு செய்யப்பட்ட பெப்டைட்களில் டெட்ராசோல் குழுக்களை அறிமுகப்படுத்தினோம். இந்த பெப்டைடுகள் Fmoc வேதியியலைப் பயன்படுத்தி திட-கட்ட முறை மூலம் ஒருங்கிணைக்கப்பட்டன. இரண்டு ஒப்புமைகளின் விஷயத்தில், பின்வரும் ஸ்பெக்ட்ரா பதிவு செய்யப்பட்டது: TOCSY, NOESY, ROESY, DQF-COSY மற்றும் வெப்பநிலையின் தொகுப்பு. இறுதி கட்டமைப்புகளைப் பெற, XPLOR 3.11 நிரலில் செயல்படுத்தப்பட்டபடி CHARMM விசைப் புலத்தைப் பயன்படுத்தி கட்டுப்படுத்தப்பட்ட மூலக்கூறு இயக்கவியல் உருவகப்படுத்துதல்களைச் செய்தோம். எங்கள் கணக்கீடுகள் ஒவ்வொன்றும் 10 இணக்கங்கள் கொண்ட இரண்டு குழுமங்களை உருவாக்கியது. பெறப்பட்ட கட்டமைப்புகளை ஒப்பிடுகையில், 1,5-பதிலீடு செய்யப்பட்ட டெட்ராசோல் வளையத்தின் அறிமுகம் உள்நாட்டிலும் உலக அளவிலும் முப்பரிமாண கட்டமைப்பை பாதிக்கிறது என்பதைக் கண்டறிந்தோம்.