மீன்வளர்ப்பு ஆராய்ச்சி மற்றும் மேம்பாட்டு இதழ்

சுருக்கம்

ஜீன்2பாத்: ஆர்த்தோலஜஸ் ஜீன்களின் தானியங்கி தேடலின் மூலம் மீன் மரபணு பாதைகளை ஆய்வு செய்வதற்கான தரவு பகுப்பாய்வு கருவி

நடாலியா பாலேஸ்டெரோஸ், நெஸ்டர் அகுய்ரே, ஜூலியோ கோல், சாரா ஐ பெரெஸ்-பிரிட்டோ மற்றும் சில்வியா ரோட்ரிக்ஸ் செயிண்ட்-ஜீன்

உயிர்வேதியியல் மற்றும் மூலக்கூறு சோதனைகளில் இருந்து பெரும்பாலான மரபணு ஒழுங்குமுறை பாதை தரவு மனிதர்களிடமிருந்து அல்லது பொதுவாக சோதனை விலங்கு மாதிரிகளாகப் பயன்படுத்தப்படும் இனங்களிலிருந்து பெறப்பட்டது. அதன்படி, குறிப்பிட்ட மரபணு அடையாளக் குறியீடுகள் (ஐடிகள்) அல்லது அணுகல் எண்கள் (AN) ஆகியவற்றின் அடிப்படையில் இந்தத் தரவை பகுப்பாய்வு செய்வதற்கான மென்பொருள் தொகுப்புகள், மரபணு மட்டத்தில் குறைவான பண்புகளைக் கொண்ட பிற உயிரினங்களுக்குப் பயன்படுத்த எளிதானது அல்ல. இங்கே, Gene2Path நிரலை நாங்கள் உருவாக்கியுள்ளோம், இது மைக்ரோஅரே தரவை ஒரு சுயாதீனமான, இனங்கள்-குறிப்பிட்ட வழியில் பகுப்பாய்வு செய்ய பாதை தரவுத்தளங்களை தானாகவே தேடுகிறது. ஜீப்ராஃபிஷ் போன்ற பிற நன்கு அறியப்பட்ட உயிரியல் இனங்களுக்காக வரையறுக்கப்பட்ட எலும்பியல் பாதைகளைத் தேட, நோயெதிர்ப்பு இலக்கு கொண்ட ரெயின்போ ட்ரவுட் மைக்ரோஅரேயில் இருந்து பெறப்பட்ட தரவு மூலம் இந்த முறையை நாங்கள் விளக்கியுள்ளோம், இருப்பினும் மென்பொருளை வேறு எந்த வழக்கு அல்லது ஆர்வமுள்ள இனங்களுக்கும் பயன்படுத்தலாம். "GENE2PATH" இணையத்தளமான http://gene2path.no-ip.org/cgi-bin/gene2path/index.cgi இல் ஸ்கிரிப்டுகள் மற்றும் நிரல்களும் இலவசமாகவும் கிடைக்கும். ஒரு பயனர் வழிகாட்டி மற்றும் எடுத்துக்காட்டுகள் தொகுப்புடன் வழங்கப்பட்டுள்ளன. Gene2Path மென்பொருள் NCBI தரவுத்தளங்களைத் தானாகத் தேடவும், கிராஃபிக் நெட்வொர்க் சூழலின் அடிப்படையில் பெறப்பட்ட தரவின் நேரடியான காட்சிப்படுத்தலையும் அனுமதிக்கிறது.