ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

டீப் டார்கெட் ரிசீக்வென்சிங்கில் இருந்து செருகும் நீக்குதல் பிறழ்வுகளை அடையாளம் காணுதல்

ஜார்ஜஸ் நாட்சோலிஸ், நான்சி ஜாங், கத்ரீனா வெல்ச், ஜான் பெல் மற்றும் ஹான்லீ பி ஜி

அடுத்த தலைமுறை சீக்வென்சர்களின் ஆழமான இலக்கு வரிசைமுறை திறன்களைப் பயன்படுத்தி, ஒரு நாவலான இரண்டு படி செருகல் நீக்குதல் (இன்டெல்) கண்டறிதல் அல்காரிதம் (ஐடிஏ) ஒன்றை நாங்கள் உருவாக்கியுள்ளோம், இது ஒற்றை வாசிப்பு வரிசைகளிலிருந்து அதிக கணக்கீட்டுத் திறன் மற்றும் உணர்திறன் கொண்ட இன்டெல்களை பகுதியளவு குறைவாக ஒப்பிடும் போது தீர்மானிக்க முடியும். காட்டு வகை குறிப்பு வரிசைக்கு. முதலாவதாக, விரைவான சீரமைப்பு திட்டங்களால் உருவாக்கப்பட்ட குறிப்பிட்ட வரிசை சீரமைப்பு கலைப்பொருட்களைப் பயன்படுத்தி வேட்பாளர் இன்டெல் நிலைகளை இது அடையாளம் காட்டுகிறது. இரண்டாவதாக, இது ஸ்மித்-வாட்டர்மேன் (SW) அல்காரிதத்தைப் பயன்படுத்தி, சீக்வென்ஸ் ரீட்களின் கட்டுப்படுத்தப்பட்ட துணைக்குழுவில் கேண்டிடேட் இன்டெல்லின் இருப்பிடத்தை உறுதிப்படுத்துகிறது. IDA ஆனது குறைந்த பின்னங்களில் உள்ள ஆழமான இலக்கு வரிசைமுறை தரவுகளிலிருந்து மாறுபட்ட அளவுகளில் உள்ள இன்டெல்களுக்குப் பொருந்தும் என்பதை நாங்கள் நிரூபிக்கிறோம், அங்கு இண்டல் காட்டு வகை வரிசையால் நீர்த்தப்படுகிறது. ஹீட்டோரோசைகோட்கள் மற்றும் கலப்பு சாதாரண-கட்டி திசுக்களில் ஏற்படக்கூடிய மாறி அலெலிக் அதிர்வெண்களில் இருக்கும் இன்டெல் மாறுபாடுகளைக் கண்டறிவதில் எங்கள் வழிமுறை பயனுள்ளதாக இருக்கும்.