ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

முனை-சார்ந்த பணிப்பாய்வு (இப்போது): உயர் செயல்திறன் தரவு பகுப்பாய்வு பைப்லைன்களுக்கான கட்டளை டெம்ப்ளேட் பணிப்பாய்வு மேலாண்மை கருவி

 எரிக் பி. லிப்ஸ்கி, பிரையன் ஆர். கிங், ஜெரார்ட் டிராம்ப்

அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை (NGS) அமைப்புகள் கணிசமான அளவு தேவைப்படும் தரவுகளை உருவாக்குகின்றன வழக்கமான பகுப்பாய்வு பணிகளுக்கான கணக்கீட்டு ஆதாரங்கள். கூடுதலாக, வெவ்வேறு NGS அமைப்புகளால் உருவாக்கப்படும் தரவு ஒரே மாதிரியாக இல்லை. மேலும், வழக்கமான பணிகளைச் செய்வதற்கு ஏராளமான கருவிகள் உள்ளன. NGS பணிப்பாய்வுகளை நிர்வகித்தல் என்பது தனிப்பயன் ஸ்கிரிப்ட்களை எழுதுவதை உள்ளடக்குகிறது, அவை விரைவாக சிக்கலானதாக வளரும், இது வழக்கமான உயர் செயல்திறன் கணக்கீட்டு வளங்களை குறைத்து பயன்படுத்த முடியாத பணிப்பாய்வுகளை ஏற்படுத்துகிறது, மேலும் இந்த பணிப்பாய்வுகளை நிர்வகிக்கும் ஊழியர்களின் கோரிக்கைகளை அதிகரிக்கிறது. உயர் செயல்திறன் விநியோகிக்கப்பட்ட கம்ப்யூட்டிங் (HPC) அமைப்புகளுக்கான டைனமிக் கட்டளை டெம்ப்ளேட் பணிப்பாய்வு இயந்திரமான நோட்-ஓரியண்டட் ஒர்க்ஃப்ளோவை (இப்போது) நாங்கள் வழங்குகிறோம். சிக்கலான பணிப்பாய்வுகளை வடிவமைப்பதற்கும் நிர்வகிப்பதற்கும் எங்கள் சிஸ்டம் பயன்படுத்த எளிதான உலாவி அடிப்படையிலான முன் முனையை வழங்குகிறது. ஒரு எளிய உலாவி இடைமுகத்தைப் பயன்படுத்தி பணிப்பாய்வுகள் கட்டமைக்கப்படுகின்றன, மேலும் ஒருங்கிணைந்த வேலை இயந்திரத்தால் நிர்வகிக்கப்படுகின்றன, இது முனைகளைத் துவக்குகிறது, முனை நிலையை கண்காணிக்கிறது மற்றும் HPC உள்ளமைவில் முனைகள் முழுவதும் தனிப்பட்ட வேலைகளின் முடிவுகளை செயலாக்குகிறது. அதிகப்படியான செய்தி அனுப்புவதை நாங்கள் குறைக்கிறோம் சார்புகளை சந்திக்கும் போது பணிப்பாய்வுகளில் பணிகளைத் தொடங்க முனைகளில் சுமையை வைப்பதன் மூலம் முனைகள், அதாவது முனை சார்ந்த பணிப்பாய்வு. எங்களின் அமைப்பு மருத்துவ ஆராய்ச்சி அமைப்பில் NGS செயலாக்கத்திற்காக வடிவமைக்கப்பட்டது, பயனர் எளிமை, கருவி அளவிடுதல், பணிப்பாய்வுகளில் பணிநீக்கத்தைக் குறைத்தல், HPC சூழலில் செயல்திறனை அதிகரிக்கும். மேலும், NOW ஆனது NGS பைப்லைன் நிர்வாகத்திற்கு மட்டுப்படுத்தப்படவில்லை, ஆனால் எந்த கணக்கீட்டு பைப்லைனையும் நிர்வகிக்கப் பயன்படுத்தலாம்.