ஜர்னல் ஆஃப் பார்மகோஜெனோமிக்ஸ் & பார்மகோபுரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

Methanopyrus kandleri AV19 இன் முழுமையான ஜீனோமில் உள்ள செலினோசைஸ்டீன் டிஆர்என்ஏவின் அடக்குமுறை மாறுபாடுகள்

உத்தம் ராய்மண்டல், ஷிப் சங்கர் தாஸ், ரியா ரக்ஷித் மற்றும் சத்யபிரதா சாஹூ4*

ஆர்க்கியாவில், முந்தைய ஆய்வுகள் பல இன்ட்ரான் கொண்ட டிஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் பிளவு டிஆர்என்ஏக்கள் இருப்பதை வெளிப்படுத்தியுள்ளன. ஆர்க்கியாவில் பல்வேறு வகையான சீர்குலைந்த டிஆர்என்ஏ மரபணுக்கள் இருப்பதால், தொல்பொருள் டிஆர்என்ஏ மரபணுக்களின் முழு ஆய்வு செய்யப்படாத பகுப்பாய்வு பயோ இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் துறையில் ஒரு சவாலான பணியாகவே உள்ளது. காணாமல் போன டிஆர்என்ஏக்களின் அடக்குமுறை மாறுபாடுகளை உருவாக்க டிஆர்என்ஏ பாதிகளை குறியாக்கம் செய்யும் பரவலாக பிரிக்கப்பட்ட மரபணுக்களைத் தேடும் ஒரு கணக்கீட்டு முறையை இங்கே நாங்கள் பரிந்துரைத்தோம். மரபணு முழுவதும் பரவலாகப் பிரிக்கப்பட்ட டிஆர்என்ஏ மரபணுக்கள் இருப்பதைக் கருத்தில் கொண்டு, டிஆர்என்ஏவின் பாதுகாக்கப்பட்ட டெர்மினல் 5'- மற்றும் 3'-மூலம் இரண்டையும் தேடுவதன் மூலம் பிரிக்கப்பட்ட டிஆர்என்ஏ மரபணுக்களைக் கணிக்க எங்கள் டிஆர்என்ஏ தேடல் அல்காரிதத்தை உருவாக்கினோம். க்ளோவர்லீஃப் கணிப்பு மற்றும் வீக்கம்-ஹெலிக்ஸ்-புல்ஜின் சிலிகோ தீர்மானத்தில் துல்லியமானது பிளவு தளங்களில் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு. காணாமல் போன டிஆர்என்ஏ மரபணுக்களுக்கான விரிவான தேடலின் மூலம், மெத்தனோபைரஸ் கேண்ட்லேரி ஏவி19 இல் செருகப்பட்டிருந்த செலினோசைஸ்டீன் டிஆர்என்ஏவின் புதிய மாறுபாடுகளை நாங்கள் வகைப்படுத்தினோம் . M. kandleri AV19 இன் முழுமையான மரபணு வரிசையின் பகுப்பாய்வு செலினோசைஸ்டைன் (Sec) ஐப் படிக்க, குறியிடப்படாத RNA டிகோடிங் UGA இன் பல படியெடுத்தல் முறையை வெளிப்படுத்தியது.