ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

ஆர் மற்றும் பயோகண்டக்டரைப் பயன்படுத்தி ஹை த்ரோபுட் ஜீனோமிக் டேட்டாவின் காட்சிப்படுத்தல்

ருச்சி யாதவ் மற்றும் பிராச்சி ஸ்ரீவஸ்தவா

டிஎன்ஏ மைக்ரோ அரேய்ஸ், தொழில்நுட்பம் குறிப்பிட்ட செல்கள் அல்லது திசுக்களில் உள்ள mRNA அளவை ஒரே நேரத்தில் பல மரபணுக்களுக்கு அளவிடுவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. மூலக்கூறு உயிரியலில் மைக்ரோஅரே சில முடிவுக்கு வழிவகுக்கும் உயிரியல் தகவல்களைப் பிரித்தெடுக்க கடுமையான கணக்கீட்டு பகுப்பாய்வு தேவைப்படும் பெரிய தரவுத்தொகுப்புகளில் விளைகிறது. மைக்ரோஅரே சிப்பை அச்சிடுவது முதல் கலப்பினம் மற்றும் ஸ்கேனிங் செயல்முறை வரை இது தரவின் தரத்தில் மாறுபாடுகளை விளைவிக்கிறது, இதன் காரணமாக உண்மையான தகவல் தொலைந்து போகலாம் அல்லது அதிகமாக குறிப்பிடப்படுகிறது. மைக்ரோஅரே முடிவுகளில் உட்பொதிக்கப்பட்ட உயிரியல் தகவல்களின் செயலாக்கம் மற்றும் உயிரியல் விளக்கத்திற்காக வெவ்வேறு நிலையில் வெவ்வேறு மாதிரிகளிலிருந்து பெறப்பட்ட மரபணு வெளிப்பாடு முடிவுகளை ஒப்பிடுவது தொடர்பான கணக்கீட்டு பகுப்பாய்வு ஒரு முக்கிய பங்கைக் கொண்டுள்ளது. மைக்ரோஅரே மரபணு வெளிப்பாடு தரவின் தரக் கட்டுப்பாடு மற்றும் காட்சிப்படுத்தல் ஆகியவை அடிப்படை, ஆனால் சவாலான பணியாகும். மைக்ரோஅரே பகுப்பாய்விற்கான மிகவும் பிரபலமான தளங்களில் ஒன்று பயோகண்டக்டர் ஆகும், இது ஆர் நிரலாக்க மொழியின் அடிப்படையில் மரபணு தரவுகளின் பகுப்பாய்வு மற்றும் புரிதலுக்கான திறந்த மூல மற்றும் திறந்த மேம்பாட்டு மென்பொருள் திட்டமாகும். GEO தரவுத்தளமான GSE53890 இலிருந்து தரவைப் பயன்படுத்தி அஃபிமெட்ரிக்ஸ் ஜீன் சிப்பின் தர மதிப்பீட்டை மேற்கொள்வதற்கான குறிப்பிட்ட நடைமுறைகளை இந்தத் தாள் விவரிக்கிறது மற்றும் விரிவான பகுப்பாய்விற்கான காட்சிப்படுத்தல் அடுக்குகளைக் குறிக்கும் பயோகண்டக்டரின் தரக் கட்டுப்பாட்டு தொகுப்புகளை விவரிக்கிறது. விஞ்ஞான விளக்கங்களுடன் அஃபிமெட்ரிக்ஸ் சிப்பின் தரக் கட்டுப்பாட்டுப் பகுப்பாய்விற்காக மைக்ரோஅரே பகுப்பாய்வில் பணிபுரியும் எந்தவொரு ஆராய்ச்சியாளருக்கும் இந்தக் கட்டுரை உதவியாக இருக்கும்.