ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

தாவரங்களில் மைக்ரோஆர்என்ஏ அடையாளம் காண ஒரு கணக்கீட்டு அணுகுமுறை: ஆர்என்ஏ-செக் தரவுகளுடன் மரபணு அடிப்படையிலான கணிப்புகளை இணைத்தல்

ஜார்ஜ் எஸ் ஒலிவேரா, நுனோ டி மென்டிஸ், விக்டர் கரோச்சா, கிளாரா கிராசா, ஜார்ஜ் ஏ பைவா மற்றும் அனா டி ஃப்ரீடாஸ்

மைக்ரோஆர்என்ஏக்கள் எண்டோஜெனஸ் மூலக்கூறுகள் ஆகும், அவை இலக்கு வைக்கப்பட்ட மெசஞ்சர் ஆர்என்ஏக்களை அமைதிப்படுத்துகின்றன, மேலும் அவை தாவரங்கள் மற்றும் விலங்குகள் இரண்டிலும் உள்ள பல உடலியல் செயல்முறைகளில் முக்கிய ஒழுங்குமுறை பங்கைக் கொண்டுள்ளன. விலங்குகளில் மைக்ரோஆர்என்ஏ கண்டுபிடிப்பதற்காக முதலில் உருவாக்கப்பட்ட ஒற்றை-மரபணு மைக்ரோஆர்என்ஏ கண்டுபிடிப்பு கருவியான CRAVELA ஐப் பயன்படுத்தும் பைப்லைனையும், வேட்பாளர்களின் வெளிப்பாடு சுயவிவரத்தை மதிப்பிடுவதற்கு ஒரு புதிய மதிப்பெண் செயல்பாட்டை வழங்கும் NGS தரவு பகுப்பாய்வு அல்காரிதத்தையும் இங்கே நாங்கள் முன்மொழிகிறோம். மைக்ரோஆர்என்ஏ முன்னோடியின் மற்ற பகுதிகளுடன் ஒப்பிடும்போது, ​​முதிர்ந்த வரிசையிலிருந்து வரும் ஆர்என்ஏ துண்டுகளின் எதிர்பார்க்கப்படும் ஒப்பீட்டளவிலானது. இந்த அணுகுமுறை யூகலிப்டஸ் எஸ்பிபியில் சோதிக்கப்பட்டது. அவற்றின் பொருளாதார முக்கியத்துவம் இருந்தபோதிலும், மைக்ரோஆர்என்ஏக்கள் எதுவும் ஆவணப்படுத்தப்படவில்லை. எங்கள் அணுகுமுறையின் விளைவு, பாதுகாக்கப்பட்ட மற்றும் பாதுகாக்கப்படாத வரிசைகள் உட்பட, வேட்பாளர்களின் குறுகிய பட்டியலாகும். சோதனைச் சரிபார்ப்பு, சிறந்த மதிப்பெண் பெற்ற பாதுகாக்கப்படாத வரிசைகளிலிருந்து தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட 8 பேரில் 6 பேரில் பெருக்கத்தைக் காட்டியது.