பரம்பரை மரபியல்: தற்போதைய ஆராய்ச்சி

சுருக்கம்

அபியோடிக் அழுத்த நிலைமைகளின் கீழ் டென்ட்ரோபியம் அஃபிசினேலின் டை1-கோபியா குழு ரெட்ரோட்ரான்ஸ்போசன்களை செயல்படுத்துதல்

காங் லி, யுவான் ஜியாங், யான்ஹுய் காவ், ஜின்பிங் சி

யுனிவர்சல் ப்ரைமர் Ty1-copia retrotransposon reverse transcriptase (RT) ஐப் பயன்படுத்துவதன் மூலம், குளிர் அழுத்தம் மற்றும் சவ்வூடுபரவல் அழுத்தத்தால் தூண்டப்பட்ட சுமார் 260 bp இன் பாதுகாக்கப்பட்ட தலைகீழ் டிரான்ஸ்கிரிப்டேஸ் டொமைன், RTPCR ஆல் டென்ட்ரோபியம் அஃபிசினேலில் இருந்து பெருக்கப்பட்டது, இது ரெட்ரோபோசன் என்பதைக் குறிக்கிறது. மன அழுத்த சூழ்நிலைகளால் செயல்படுத்தப்படலாம். ஆம்பிளிகான்கள் மீட்டெடுக்கப்பட்டு தொடர்புடைய உயிர் தகவலியல் மென்பொருள் மூலம் வரிசைப்படுத்துதல் மற்றும் பகுப்பாய்வு செய்வதற்காக குளோன் செய்யப்பட்டன. 78 Ty1-copia போன்ற ரெட்ரோட்ரான்ஸ்போசன் RTகள் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனலாக செயல்படுத்தப்பட்டது உயர் பன்முகத்தன்மையுடன் பெறப்பட்டது. இந்த வரிசைகளின் நீளம் 245 முதல் 265 பிபி வரை மாறுபடுகிறது, அனைத்து வரிசைகளும் ஏடியில் நிறைந்திருந்தன மற்றும் ஹோமோலஜி 42.9% முதல் 99.2% வரை இருந்தது. CAAT பெட்டி, TATA பாக்ஸ் பாதுகாக்கப்பட்ட வரிசைகள் மற்றும் வேறு சில ஒழுங்குமுறை கூறுகளுடன் தொடர்புடைய மன அழுத்த சூழ்நிலைகள் மற்றும் தொடக்க டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் சிக்னல்கள் ஆகியவற்றால் தூண்டப்பட்ட மரபணுவின் ரெட்ரோட்ரான்ஸ்போசன் RT போன்ற Ty1-copia போன்றது. Ty1-copia retrotransposons இன் ரிவர்ஸ் டிரான்ஸ்கிரிப்டேஸ் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனலாக செயல்படுத்தப்பட்ட அழுத்த நிலைமைகளால் தூண்டப்பட்ட cis-செயல்படும் ஒழுங்குமுறை கூறுகள், மரபணுவின் ரெட்ரோட்ரான்ஸ்போசன் RT போன்ற Ty1-copia ஐ விட கணிசமாக அதிகரித்தன. அமினோ அமிலங்களாக மொழிபெயர்க்கப்படும் போது, ​​சில வரிசைகள் ஸ்டாப் கோடான் பிறழ்வு அல்லது/மற்றும் பிரேம்ஷிஃப்ட் பிறழ்வை வழங்கின, மேலும் அனைத்து வரிசைகளும் "SLYGKQ" பாதுகாக்கப்பட்ட வரிசையில் பிறழ்வை வழங்குகின்றன. அவற்றின் அமினோ அமில வரிசைகளின் சீரமைப்பு பகுப்பாய்வுகளுக்குப் பிறகு பைலோஜெனிக் பகுப்பாய்வு மூலம் நான்கு பிரிவுகள் அடையாளம் காணப்பட்டன, மேலும் Ty1-copia போன்ற retrotransposon RT குறைந்த ஹோமோலஜி கொண்ட மரபணுவைக் கொண்டது, இது அழுத்தத்தின் கீழ் Ty1-copia retrotransposons-ன் தலைகீழ் டிரான்ஸ்கிரிப்டேஸ் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனலாக செயல்படுத்தப்பட்டதைக் குறிக்கிறது. Ty1-copia போன்றவற்றுடன் குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் மரபணுவின் ரெட்ரோட்ரான்ஸ்போசன் ஆர்டி.