தாவர நோயியல் & நுண்ணுயிரியல் இதழ்

சுருக்கம்

கருப்பு மிளகு கால் அழுகல் நோய்க்கான காரணமான பைட்டோபதோரா கேப்சிசியிலிருந்து முழு நீள எலிசிடின் மரபணுவின் பெருக்கம், குளோனிங் மற்றும் சிலிகோ கணிப்பு

விஜேஷ் குமார் ஐபி, ரீனா என், ஆனந்தராஜ் எம், ஈபன் எஸ்ஜே, ஜான்சன் ஜிகே மற்றும் வினிதா கேபி

எலிசிடின்கள் என்பது பைட்டோபதோராவால் சுரக்கப்படும் சிறிய புரதங்களின் குடும்பமாகும், இது பாதிக்கப்பட்ட தாவரங்களில் இலை நசிவைத் தூண்டுகிறது. இங்கே, எலிசிடின் மரபணுவை P. கேப்சிசியிலிருந்து குளோனிங் செய்வதைப் புகாரளிக்கிறோம், இது ஒரு ஓமைசீட் தாவர நோய்க்கிருமியாகும், இது பரந்த அளவிலான புரவலன் தாவரங்களுக்கு குறிப்பிடத்தக்க சேதத்தை ஏற்படுத்துகிறது. பிற பைட்டோபதோரா உயிரினங்களின் அறியப்பட்ட எலிசிடின் மரபணுக்களிலிருந்து அவற்றின் பாதுகாக்கப்பட்ட மையக்கருத்துகளின் அடிப்படையில் வடிவமைக்கப்பட்ட ப்ரைமர்களைப் பயன்படுத்தி எலிசிடின் வரிசை பெருக்கப்பட்டது. 256 bp நீளம் கொண்ட PCR பெருக்கப்பட்ட தயாரிப்பு அளவு மற்றும் வரிசைப்படுத்தப்பட்ட தயாரிப்பின் BLAST பகுப்பாய்வு P. கேப்சிசியின் ஆல்பா-எலிசிடின் வரிசைகளுடன் சரியான பொருத்தத்தைக் காட்டியது. அதன்பிறகு, எலிசிட்டினின் முழுமையான மரபணுவை பி. கேப்சிசியின் மரபணு வரிசைத் தகவலில் இருந்து வகைப்படுத்த முயற்சி செய்யப்பட்டது. முழு மரபணுவிற்கு எதிரான உள்ளூர் BLAST தேடல் முழு குறியீட்டு வரிசையையும் அடையாளம் கண்டுள்ளது. மேலும் வரிசை பகுப்பாய்வு, பாதுகாக்கப்பட்ட 6 சிஸ்டைன் எச்சங்களுடன், விளம்பரதாரர் வரிசை, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடக்க தளம், ஒரு லீடர் சிக்னல் சீக்வென்ஸ் மற்றும் ஒரு கோர் எலிசிடின் டொமைன் ஆகியவற்றை அடையாளம் கண்டுள்ளது. கூடுதலாக, கேப்சிசினின் முப்பரிமாண அமைப்பு மாதிரியாக வடிவமைக்கப்பட்டது, மேலும் ஸ்டெரால் மற்றும் கேப்சைசின் பிணைப்பு தொடர்பு மூலக்கூறு நறுக்குதலைப் பயன்படுத்தி ஆய்வு செய்யப்பட்டது. உருவாக்கப்பட்ட மாதிரியானது Tyr 47க்கான வலுவான பிணைப்பு உறவைக் கணித்துள்ளது.