ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

BioGyan: இலக்கியத்திலிருந்து மரபணு செயல்பாடுகளை அடையாளம் காண ஒரு கருவி

சிவ குமார், விஜய்குமார் கடகே, இந்துப்ரியா சுப்ரமணியன், ஆர்த்தி தேசாய், விவேக் கே சிங் மற்றும் அபய் ஜெரே

பின்னணி: வாழ்க்கை அறிவியல் ஆராய்ச்சியின் முதன்மை நோக்கம் சிக்கலான செல்லுலார் வழிமுறைகள் மற்றும் பல செல்லுலார் செயல்முறைகளில் பல்வேறு மரபணுக்கள்/புரதங்களின் இடைவினைகளை புரிந்துகொள்வதாகும். இதற்காக, UniProt, Protein Data Bank (PDB) மற்றும் Reactome போன்ற பல தரவுத்தளங்கள் இருந்தாலும் பப்மெட் உயிரியல் மருத்துவத் தகவலின் முதன்மை ஆதாரமாக உள்ளது.

குறிக்கோள்: உயர்-செயல்திறன் தொழில்நுட்பங்கள் மற்றும் பல தரவுத்தளங்களிலிருந்து கிடைக்கக்கூடிய பெரிய அளவிலான தரவுகளுடன், மரபணு-செயல்முறை-பினோடைப்பிற்கான தொடர்புடைய தகவலைக் கண்டறிவது இப்போது மிகவும் சவாலானதாகவும் கடினமானதாகவும் மாறியுள்ளது. முழுமையான தகவலைப் பெறுவதற்கு PubMed மற்றும் பல தரவுத்தளங்களை ஒரே நேரத்தில் தேடுவதற்கு எந்த கருவியும் தற்போது கிடைக்கவில்லை. மேலும், ஒரு பொதுவான பப்மெட் தேடல் அதிக எண்ணிக்கையிலான கட்டுரைகளை வழங்குகிறது, அவை தொடர்புடைய இலக்கியங்களை அடையாளம் காண கைமுறையாக திரையிடப்பட வேண்டும். எனவே, பப்மெட் மற்றும் பிற தொடர்புடைய தரவுத்தளங்களில் மரபணுக்கள், செல்வகைகள் மற்றும் செல்லுலார் செயல்முறைகளுக்கான ஒருங்கிணைந்த தேடலை எளிமையாக்க BioGyan என்ற இலக்கியச் சுரங்கக் கருவியை உருவாக்கினோம்.

முறைகள்: பயனர் தேடல் சொற்களுடன் தொடர்புடைய கட்டுரைகளை தரவரிசைப்படுத்த BioGyan ஒரு வலுவான மதிப்பெண் முறையைப் பயன்படுத்துகிறது. ஸ்கோரிங் முறையானது, மரபணு, செயல்முறை மற்றும் இடைவினைச் சொற்களின் கூட்டு நிகழ்வுகளின் எடையுள்ள தொகையை அடிப்படையாகக் கொண்டது.

முடிவுகள்: BioGyan வினவப்பட்ட மரபணுக்கள் மற்றும் செயல்முறைகளுக்கு இடையேயான தொடர்பை ஆதரிக்கும் PubMed கட்டுரைகளை மீட்டெடுக்கிறது, பாதை தரவுத்தளங்களிலிருந்து தொடர்புடைய பாதைகள் மற்றும் PDB இலிருந்து 3-பரிமாண கட்டமைப்புகள். எளிதாகப் பார்க்க, பயனருக்கான அனைத்துத் தகவல்களும் ஒற்றைச் சாளரத்தில் கிடைக்கும். பயோஜியன் 85.46% துல்லியத்தைக் காட்டியது, மரபணு-செயல்முறைக் கூட்டமைப்பிற்கான கட்டுரைகளின் தொடர்பைக் கணித்து, PESCADOR ஐ விட சிறப்பாகச் செயல்பட்டது.

முடிவு: BioGyan ஆனது, மரபணுக்களின் தொகுதி வினவல் மற்றும் செயல்முறைகள், கட்டுரைகளை ஆஃப்லைனில் படித்தல், கட்டுரைகளின் பட்டியலை புத்தகப் பட்டியலாக ஏற்றுமதி செய்தல் மற்றும் கட்டுரையின் பொருத்தத்தை பயனர் திருத்துவதற்கான நெகிழ்வுத்தன்மை போன்ற பல முக்கிய அம்சங்களைக் கொண்டுள்ளது, இது இலக்கியத் தேடலுக்கான முக்கிய கருவியாக அமைகிறது. இவ்வாறு, BioGyan என்பது ஒரு தனித்துவமான கருவியாகும், இது முழு செயல்முறையையும் பெரிதும் தானியங்குபடுத்தும் போது பல தரவுத்தளங்களில் முழுமையான தேடலை வழங்குகிறது.