ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

உயிர் தகவலியல் மற்றும் முதுகெலும்பு கணைய லிபேஸ் மற்றும் தொடர்புடைய புரதங்கள் மற்றும் மரபணுக்களின் பரிணாமம்

ரோஜர் எஸ் ஹோம்ஸ் மற்றும் லாரா ஏ காக்ஸ்

பின்னணி: கணையத்தில் இருந்து சுரக்கும் சிறுகுடலில் குழம்பாக்கப்பட்ட கொழுப்புகளின் நீராற்பகுப்பில் கோலிபேஸ் முன்னிலையில் கணைய லிபேஸ் (PTL) செயல்படுகிறது. கணைய லிபேஸ் தொடர்பான புரதம் 1 (PLR1) கணைய சுரப்புகளிலும் காணப்படுகிறது மற்றும் லிபோலிசிஸில் ஒழுங்குபடுத்தும் பங்கைச் செய்யலாம்; PLR2 கணைய ட்ரைகிளிசரைடு மற்றும் கேலக்டோலிபேஸ் எதிர்வினைகளை ஊக்குவிக்கிறது, அதே நேரத்தில் PLR3 தொடர்புடைய ஆனால் அறியப்படாத லிபேஸ் செயல்பாட்டைச் செய்யலாம் ஒப்பீட்டு PTL, PLR1, PLR2 மற்றும் PLR3 அமினோ அமில வரிசைகள் மற்றும் கட்டமைப்புகள் மற்றும் மரபணு இருப்பிடங்கள் மற்றும் தொடர்கள் பல முதுகெலும்பு மரபணு திட்டங்களின் தரவைப் பயன்படுத்தி ஆய்வு செய்யப்பட்டன.

முறைகள்: வரிசை சீரமைப்புகள் மற்றும் பாதுகாக்கப்பட்ட கணிக்கப்பட்ட இரண்டாம் நிலை மற்றும் மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்புகள் ஆய்வு செய்யப்பட்டு, மனித மற்றும் பன்றி PTL பற்றிய முந்தைய அறிக்கைகளின் அடிப்படையில் முக்கிய அமினோ அமில எச்சங்கள் மற்றும் களங்கள் அடையாளம் காணப்பட்டன. UC சாண்டா குரூஸ் ஜீனோம் உலாவியைப் பயன்படுத்தி முதுகெலும்பு PTL போன்ற மரபணுக்களின் ஒப்பீட்டு பகுப்பாய்வு நடத்தப்பட்டது. பைலோஜெனி ஆய்வுகள் இந்த முதுகெலும்பு PTL போன்ற மரபணுக்களின் பரிணாமத்தை ஆராய்ந்தன.

தரவு: மனித மற்றும் சுட்டி PTL வரிசைகள் 78% அடையாளங்களைப் பகிர்ந்து கொண்டன, ஆனால் மனித மற்றும் மவுஸ் PLR1 மற்றும் PLR2 வரிசைகளுடன் 64-68% அடையாளங்கள் மட்டுமே உள்ளன. பல முதுகெலும்பு PTL மற்றும் PTL போன்ற புரத களங்கள் ஒரு N-சிக்னல் பெப்டைட் உட்பட உயிர் தகவலியல் மூலம் கணிக்கப்பட்டது; N-கிளைகோசைலேஷன் தளம்(கள்); வினையூக்கி முக்கோணத்தைக் கொண்ட α/β ஹைட்ரோலேஸ் மடிப்புப் பகுதி; செயலில் உள்ள தளத்திற்கான 'மூடி' பகுதி; லிபேஸ் மற்றும் PLAT பகுதிகளை பிரிக்கும் ஒரு 'கீல்'; மற்றும் சி-டெர்மினல் PLAT பகுதி. யூதேரியன் பாலூட்டிகளின் PLR1 தொடர்கள் ட்ரையசில்கிளிசரால் லிபேஸ் செயல்பாட்டின் இழப்புக்கு காரணமான எச்சங்களை (196Val/198Ala) தக்கவைத்துக்கொண்டது, அதேசமயம் குறைந்த முதுகெலும்பு PLR1 வரிசைகள் 'செயலில்' லைபேஸ் எச்சங்களைத் தக்கவைத்துக்கொள்கின்றன. இதற்கு நேர்மாறாக, பாலூட்டிகளின் PTL, PLR2 மற்றும் PLR3 வரிசைகள் லிபேஸ் 'ஆக்டிவ்' எச்சங்களை வெளிப்படுத்தின (196Ala/198Pro); கோழி மற்றும் தவளை PLR1 வரிசைகள் லிபேஸ் 'செயலில்' எச்சங்களை தக்கவைத்துக்கொள்கின்றன; மற்றும் opossum மற்றும் platypus PLR1 வரிசைகள் 196Ala/Ser198 மற்றும் 196Ser/198Pro எச்சங்களை வெளிப்படுத்தின. ஒரு பைலோஜெனடிக் மர பகுப்பாய்வு நான்கு தனித்துவமான முதுகெலும்பு PTL போன்ற மரபணு குடும்பங்களுக்கான ஆதாரங்களை வழங்கியது.

முடிவுரைகள்: கணைய லிபேஸ் (PTL) மற்றும் தொடர்புடைய மரபணுக்கள் மற்றும் புரதங்கள் (PLR1 மற்றும் PLR2) ஆய்வு செய்யப்பட்ட அனைத்து முதுகெலும்பு மரபணுக்களிலும் உள்ளன, அதேசமயம் PLR3 ப்ரைமேட் மரபணுக்களில் மட்டுமே காணப்படுகிறது. முதுகெலும்பு PLR1 இன் 'செயலற்ற' வடிவம் யூதேரியன் பாலூட்டிகளுக்கு மட்டுமே. முதுகெலும்பு PTL போன்ற மரபணுக்கள், ஒரு மூதாதையர் PTL போன்ற மூதாதையர் மரபணுவின் மரபணு நகல் நிகழ்வுகளைத் தொடர்ந்து முதுகெலும்பு மூதாதையரில் தோன்றியதாகத் தெரிகிறது. PTL-போன்ற மரபணு பரிணாம வளர்ச்சியின் இரண்டு தனித்தனி கோடுகள் கீழ் முதுகெலும்புகளில் (PTL/PLR1 மற்றும் PLR2) முன்மொழியப்பட்டுள்ளன, மேலும் ப்ரைமேட் மரபணுக்களுக்கு மேலும் மரபணு நகல் நிகழ்வு (PLR2/PLR3) உள்ளது.