ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

மைட்டோகாண்ட்ரியல் மற்றும் சைட்டோபிளாஸ்மிக் பைரோபாஸ்பேடேஸ் (பிபிஏ) மரபணுக்கள் மற்றும் புரதங்களின் ஒப்பீட்டு மற்றும் பரிணாம ஆய்வுகள்

ரோஜர் எஸ் ஹோம்ஸ், கிம்பர்லி டி ஸ்ப்ராட்லிங்-ரீவ்ஸ் மற்றும் லாரா ஏ காக்ஸ்

கனிம பைரோபாஸ்பேடேஸ் (PPA; PPase) (EC: 3.6.1.1) என்பது டைபாஸ்பேடேஸ் என்சைம் குடும்பத்தைச் சேர்ந்தது, இது முதுகெலும்பு திசுக்களின் சைட்டோபிளாசம் (PPA1) மற்றும் மைட்டோகாண்ட்ரியா (PPA2) ஆகியவற்றிற்குள் டைபாஸ்பேட் ஹைட்ரோலேஸாக செயல்படுகிறது. பிபிஏ1 மற்றும் பிபிஏ2 அமினோ அமில வரிசைகள் மற்றும் கட்டமைப்புகள் மற்றும் பிபிஏ போன்ற மரபணு இருப்பிடங்கள் பல மரபணு திட்டங்களில் இருந்து உயிர் தகவல் தரவுகளைப் பயன்படுத்தி ஆய்வு செய்யப்பட்டன. வரிசை சீரமைப்புகள் மற்றும் முக்கிய பாதுகாக்கப்பட்ட அமினோ அமில எச்சங்களும் ஆய்வு செய்யப்பட்டன (மனித பிபிஏ2 எச்சங்கள் அடையாளம் காணப்பட்டன): மைட்டோகாண்ட்ரியல் சிக்னல் பெப்டைட் (1-31); மற்றும் செயலில் உள்ள தள எச்சங்கள் Mg2+ பிணைப்பு (164Asp, 169Asp மற்றும் 201Asp), அடி மூலக்கூறு பிணைப்பு (127Arg) மற்றும் புரோட்டான் நன்கொடை தளமாக (138Tyr) செயல்படுகின்றன. அறிக்கையிடப்பட்ட ஈஸ்ட் பிபிஏ1 அமைப்பைப் பயன்படுத்தி முதுகெலும்பு பிபிஏ1 மற்றும் பிபிஏ2 க்கு கணிக்கப்பட்ட 2டி மற்றும் 3டி கட்டமைப்புகள் அடையாளம் காணப்பட்டன (PDB: 1E9G). முதுகெலும்பு பிபிஏ1 மற்றும் பிபிஏ2 மரபணுக்கள் வழக்கமாக முறையே 11 அல்லது 12 கோடிங் எக்ஸான்களைக் கொண்டிருக்கும், நீட்டிக்கப்பட்ட எக்ஸான் 1 மற்றும் கூடுதல் எக்ஸான் 3 ஆகியவை முதுகெலும்பு பிபிஏ2 மரபணுக்களுக்குக் காணப்படுகின்றன. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி பிணைப்பு தளங்கள் மற்றும் CpG104 ஆகியவை மனித PPA2 மரபணு ஊக்குவிப்பாளருக்குள் அடையாளம் காணப்பட்டன; மற்றும் PPA2 3'UTRக்கான MiR-590. பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வுகள், ஒரு மூதாதையர் முதுகெலும்பில்லாத பிபிஏ மரபணு ஒரு மரபணு நகல் நிகழ்வுக்கு உட்பட்டு முதுகெலும்பு மரபணு பரிணாமத்தின் 2 தனித்தனி வரிகளை உருவாக்கியது: PPA1 மற்றும் PPA2.