Comoé Koffi Donatien Benie, Adjéhi Dadié, David Coulibaly N'Golo, Nathalie Guessennd, Solange AKA, Koffi Marcellin DJE மற்றும் Mireille Dosso
பி. ஏருகினோசா உணவில் விஷம் கலந்து இருக்கலாம். நோயெதிர்ப்பு குறைபாடுள்ள நபர்களுக்கு இது மிகவும் நோய்க்கிருமியாக உள்ளது அல்லது பலவீனமடைந்து, அதிக நோயுற்ற தன்மை மற்றும் இறப்பு விகிதத்தை ஏற்படுத்துகிறது. இந்த ஆய்வின் நோக்கம் சூடோமோனாஸ் ஏருகினோசாவின் மூலக்கூறு அடையாளம் காண பொருத்தமான பைலோஜெனடிக் மார்க்கரைத் தீர்மானிப்பதாகும். நியூக்ளிக் அமிலங்களின் தூய்மை மற்றும் செறிவு ஸ்பெக்ட்ரோஃபோட்டோமெட்ரி மூலம் தீர்மானிக்கப்பட்டது. பைலோஜெனடிக் குறிப்பான்களைப் பயன்படுத்தி உணர்திறன் எதிர்வினைகள் (16S RNAr, recA, rpoB, STS1) மற்றும் 42 விகாரங்களின் நுழைவு கண்டறிதல் பாலிமரேஸ் சங்கிலி எதிர்வினை (PCR) மூலம் மதிப்பிடப்பட்டது. 2.1 இன் 230 nm இல் சராசரி உறிஞ்சுதலுடன், DNA சாற்றில் 1.7 சராசரி விகிதம் (A260/A280) உள்ளது. சூடோமோனாஸ் ஏருகினோசா குறிப்பு திரிபு ATCC 27853 இன் நுழைவாயில் கண்டறிதல் rpoB க்கு 0.8 μg/ml மற்றும் 16S குறிப்பான்கள் RNAr மற்றும் recA ஒவ்வொன்றிற்கும் 7.6 μg/ml ஆகும். நேர்மறை கட்டுப்பாட்டு விகாரங்கள் CP2: 1125A மற்றும் CP3: API ஆகியவை முறையே rpoB மரபணுவைப் பயன்படுத்துவதற்கு 1.2 μg/ml மற்றும் 0.1 μg/ml ஆகும். இந்த வரம்பு முறையே 12.3 μg/ml மற்றும் recA மரபணுவிற்கு 0.9 μg/ml ஆகும். rpoB வீட்டு பராமரிப்பு மரபணுவின் உணர்திறன் 97.4% ஆக இருந்தது, அதைத் தொடர்ந்து recA மற்றும் 16S RNAr முறையே 87.2% மற்றும் 82.1%. rpoB மரபணுக்களின் பைலோஜெனடிக் தீர்மானம் 16S rRNA மற்றும் recA மரபணுக்களை விட அதிகமாக இருந்தது. ITS1 மார்க்கருடன் எந்த உணர்திறன் எதிர்வினையும் காணப்படவில்லை. நியூக்ளிக் அமிலங்களின் தரம், தூய்மை மற்றும் பைலோஜெனடிக் மார்க்கரின் தேர்வு ஆகியவை PCR பகுப்பாய்விற்கான மிக முக்கியமான காரணிகளாகும்.