ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

ஏடிபி-ரைபோஸ்-1′′-மோனோபாஸ்பேடேஸின் ஒப்பீட்டு மரபணு பகுப்பாய்வு 19 அரபிடோப்சிஸ் தலியானா ஈகோடைப்ஸ்

Huifang Jiang, Haichao Wei, Chunyun Jiang, Wei Sun, Wen Dong, Nini Chen, Hui Zhang, Yanxiu Zhao மற்றும் Zenglan Wang

A1pp அல்லது MACRO டொமைனைக் கொண்ட ADP-ribose-1′′-monophosphatase ஆனது உயிரணுக்களில் ஒரு முக்கியமான செயலாக்க நொதியாகும், t-RNA செயல்முறைகளைப் பிரிப்பதில் பங்குபெறுகிறது மற்றும் ADP-ribose-1′′- மோனோபாஸ்பேட்டை ADP-ரைபோஸாக மாற்றுகிறது. அரபிடோப்சிஸ் தலியானாவில் AT1G69340 மற்றும் AT2G40600 ஆகிய இரண்டு மரபணுக்களை நாங்கள் கண்டறிந்தோம், மேலும் அமினோ அமிலத்தில் பல வேறுபாடுகள் இருந்தாலும், பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதியின் இடஞ்சார்ந்த அமைப்பு ஒத்ததாக இருப்பதைக் கண்டறிந்தோம். 19 சுற்றுச்சூழல் வகைகளின் முழு மரபணுவிலிருந்து தரவைப் பயன்படுத்தி ஊக்குவிப்பாளர், குறியீட்டுப் பகுதி மற்றும் மொழிபெயர்க்கப்படாத பகுதி ஆகியவற்றின் வரிசையின் வேறுபாட்டை நாங்கள் பகுப்பாய்வு செய்தோம், மேலும் Col-0 மற்றும் AtGenExpress தரவுத்தளத்தின் அடிப்படையில் 19 சுற்றுச்சூழல் வகைகளில் உள்ள நாற்றுகளில் உள்ள மரபணுக்களின் வெளிப்பாட்டையும் ஒப்பிட்டுப் பார்த்தோம். முறையே RNA-seq தரவு. ஒரே மரபணு சில சூழல் வகைகளில் வெவ்வேறு வெளிப்பாடு வடிவங்களைக் கொண்டிருப்பதைக் கண்டறிந்தோம் மற்றும் Col-0 இன் தரவுகளின்படி மலர் உறுப்புகள் மற்றும் விதைகளைத் தவிர இரண்டு மரபணுக்களும் ஒரே மாதிரியான வெளிப்பாடு வடிவங்களைக் கொண்டிருந்தன. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி பிணைப்பு தளங்களின் பன்முகத்தன்மைக்கு இந்த மரபணுக்களின் வெளிப்பாடுகளின் ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகள் இந்த சுற்றுச்சூழல் வகைகளில் மாறியுள்ளன என்பதை இந்த முடிவுகள் சுட்டிக்காட்டுகின்றன. எல்லாவற்றிற்கும் மேலாக, மரபணு செயல்பாடு மற்றும் மரபணுக்களின் செயல்பாட்டை ஆய்வு செய்ய பயன்படுத்தப்படும் சுற்றுச்சூழல் வகை வேட்பாளர்கள் பற்றிய விளக்கத்திற்கு எங்கள் ஆராய்ச்சி சில தகவல்களை வழங்கும்.