ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

மனித ஹெர்பெஸ் வைரஸின் கேப்சிட் புரதங்களுக்கான தொலைவு மற்றும் தன்மை அடிப்படையிலான பைலோஜெனடிக் மரத்தின் கணக்கீட்டு பகுப்பாய்வு

விபன் குமார் சோஹ்பால், அபூர்பா டே மற்றும் அமர்பால் சிங்

மூலக்கூறு பைலோஜெனடிக் என்பது பரிணாம பகுப்பாய்வின் ஒரு அடிப்படை அம்சமாகும், மேலும் இது தூரம் மற்றும் தன்மை சார்ந்த முறைகளைப் பொறுத்தது. இந்தத் தாளில், மாற்று மாதிரிகள், முழுமையான தேடலுடன் கூடிய பைலோஜெனடிக் மாதிரி மற்றும் ME நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தி புரதங்களுக்கிடையேயான உறவை பகுப்பாய்வு செய்ய HHV இன் வைரஸ் கேப்சிட் புரதங்களை ஒப்பிடுகிறோம். NJ மற்றும் UPGMA மரங்களில் வடிவ அளவுருவுடன் பாய்சன் திருத்தத்தின் விளைவும் பகுப்பாய்வு செய்கிறது. பைலோஜெனடிக் மரம் என்பது மாற்று தூரத்தின் பிரதிபலிப்பாகும் என்பதை விரிவான கணினி உருவகப்படுத்துதல் மூலம் காட்டுகிறோம். அதிகபட்ச-மினி கிளை மற்றும் பிணைப்பு முறை மற்றும் மினிமினி ஹூரிஸ்டிக் மாதிரியின் விளைவு மற்றும் எழுத்து அடிப்படையிலான மரத்துடன் தொடர்புடைய பதிவு வாய்ப்பு ஆகியவை விவாதிக்கப்பட்டன. புரோட்டீன்கள் உறவை முழுமையாக பகுப்பாய்வு செய்ய எம்எல் மற்றும் எம்பியைப் பயன்படுத்தினோம். மாற்று மாதிரிகள், வடிவ அளவுரு, தேடல் நிலை மற்றும் SBL ஆகியவை பைலோஜெனடிக் மரத்தை மறுகட்டமைப்பதில் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன என்று நாங்கள் முடிவு செய்கிறோம். மூலக்கூறு கடிகார ஆய்வு, தொலைதூர தொடர்புடைய புரதங்களை ஒப்பிடும்போது χ2 மதிப்பு அதிகமாக இருப்பதாகக் காட்டுகிறது.