ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

RET பினோடைபிக் தீவிரத்தின் கணக்கீட்டு அம்சத் தேர்வு மற்றும் வகைப்பாடு

டேவிட் கே. க்ரோக்கெட், ஸ்டீபன் ஆர். பிக்கோலோ, ஸ்காட் பி. நரஸ், ஜாய்ஸ் ஏ. மிட்செல் மற்றும் ஜூலியோ சி. ஃபேசெல்லி

RET ஆன்கோஜீனில் உள்ள பல பிறழ்வுகள் நேரடியாக பரம்பரை தைராய்டு புற்றுநோயுடன் தொடர்புடையதாக இருந்தாலும், பிற பிறழ்வுகள் நிச்சயமற்ற மரபணு மாறுபாடுகள் என பெயரிடப்பட்டுள்ளன, ஏனெனில் அவை மருத்துவ பினோடைப்புடன் தெளிவாக தொடர்புபடுத்தப்படவில்லை. ஒரு பிறழ்வின் தீவிரத்தை தீர்மானிக்கும் செயல்முறை விலை உயர்ந்தது மற்றும் நேரத்தை எடுத்துக்கொள்ளும். இந்த மரபணு வகை-பினோடைப் இடைவெளியைக் குறைக்க தகவல் கருவிகள் மற்றும் முறைகள் உதவக்கூடும். இந்த இலக்கை நோக்கி, இயந்திர கற்றல் வகைப்பாடு அல்காரிதம்கள் தீங்கற்ற மற்றும் நோய்க்கிருமி RET மரபணு மாறுபாடுகளை வேறுபடுத்தும் திறனுக்காக மதிப்பிடப்பட்டன, அவை காட்டு வகை மற்றும் பிறழ்ந்த வரிசையில் உள்ள எச்சத்தின் இயற்பியல் வேதியியல் பண்புகளின் மதிப்புகளில் உள்ள வேறுபாடுகளால் வகைப்படுத்தப்படுகின்றன. விதிகள், விரிகுடாக்கள் மற்றும் பின்னடைவு, அருகிலுள்ள அண்டை நாடு, ஆதரவு திசையன் இயந்திரங்கள் மற்றும் மரங்கள் உள்ளிட்ட பல்வேறு வகை இயந்திர கற்றல் வகைப்பாடு நுட்பங்களிலிருந்து பிரதிநிதி அல்காரிதம்கள் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன. இயந்திர கற்றல் மாதிரிகள் பிறழ்வு தீவிரத்தை கணிக்கப் பயன்படுத்தப்படும் நன்கு நிறுவப்பட்ட நுட்பங்களுடன் ஒப்பிடப்பட்டன. முதன்மை வரிசை தகவலை மட்டுமே பயன்படுத்தி RET பிறழ்வு நிலையை துல்லியமாக கணிக்க இயந்திர கற்றல் வகைப்பாடு பயன்படுத்தப்படலாம். வரிசை ஹோமோலஜி (எலும்பியல் பாதுகாப்பு) அல்லது புரதக் கட்டமைப்புத் தரவை அடிப்படையாகக் கொண்ட தற்போதைய அல்காரிதம்கள் உயர்ந்ததாக இருக்க வேண்டிய அவசியமில்லை.