தாவர நோயியல் & நுண்ணுயிரியல் இதழ்

சுருக்கம்

பிலிப்பைன்ஸில் தக்காளி இலை சுருட்டை ஏற்படுத்தும் பெகோமோவைரஸ் இனங்களை குறிப்பிட்ட முறையில் கண்டறிவதற்கான மூலக்கூறு அடிப்படையிலான முறையின் வளர்ச்சி

ஜெர்மி ராய் அகஸ்டஸ் ஐ கோம்ஸ்*

தக்காளி அதன் பொருளாதார மற்றும் ஊட்டச்சத்து மதிப்பு காரணமாக மிக முக்கியமான காய்கறி பயிர்களில் ஒன்றாகும், ஆனால் பெகோமோவைரஸால் ஏற்படும் நோய் காரணமாக , பல ஆண்டுகளாக தக்காளி உற்பத்தி குறைந்தது. தக்காளி மஞ்சள் இலை சுருட்டை அல்லது தக்காளி இலை சுருட்டை ஏற்படுத்தும் Begomoviruses உலகின் பல வெப்பமண்டல மற்றும் மிதவெப்ப மண்டல பகுதிகளில் தக்காளி உற்பத்தியை பாதிக்கிறது. இந்த தாவர வைரஸ்களில் வரையறுக்கப்பட்ட கண்டறிதல் அவற்றைக் கண்டறிவது மற்றும் கட்டுப்படுத்துவது மிகவும் கடினம். ToLCPV மற்றும் ToLCCeV இன் குறிப்பிட்ட கண்டறிதலுக்கான மூலக்கூறு அடிப்படையிலான முறையை உருவாக்குவதை இந்த ஆய்வு நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. இது செய்யப்பட்டது: 1) வெளியிடப்பட்ட ப்ரைமர்கள் பல வரிசை சீரமைப்பைப் பயன்படுத்தி ஒரு குறிப்பிட்ட பெகோமோவைரஸ் இனத்துடன் இணைக்க முடியுமா என்பதைச் சரிபார்த்தல், 2) ToLCPV அல்லது ToLCCeV இன் குறிப்பிட்ட கண்டறிதலுக்கான ப்ரைமர்களை வடிவமைத்தல் மற்றும் PCR ஆல் உகந்ததாக்குதல், 3) குறிப்பிட்ட கண்டறிதலுக்காக வடிவமைக்கப்பட்ட ப்ரைமரைச் சரிபார்த்தல் ToLCPV மற்றும் ToLCCeV களத்தில் சேகரிக்கப்பட்ட மாதிரிகளைப் பயன்படுத்தி, 4) முழு நீளத்தைப் பயன்படுத்தி RFLP வடிவத்தைக் கண்டறிய சிலிகோவில் மரபணு டிஎன்ஏ . வெளியிடப்பட்ட ப்ரைமர்கள் ToLCPV விகாரங்கள் மற்றும் ToLCCeV, ToLCMiV இனங்களுடன் இணைக்க முடிந்தது, எனவே இந்த ப்ரைமர்கள் அவற்றின் தனித்தன்மையைத் தீர்மானிக்க உண்மையான பரிசோதனையில் சரிபார்க்கப்பட வேண்டும். ப்ரைமர்கள் ToLCPV19 மற்றும் ToLCCeV19 ஆகியவை முறையே ToLCPV மற்றும் ToLCCeV இனங்களைக் கண்டறிவதற்காக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளன, மேலும் PCR ஆனது 53℃, 55℃ மற்றும் 57℃ ஆகிய வேறுபட்ட வெப்பநிலைகளுக்கு உகந்ததாக இருந்தது. ToLCPV நோயால் பாதிக்கப்பட்ட தக்காளி மாதிரிகள் மற்றும் ToLCPV19 மற்றும் ToLCCeV19 ப்ரைமர்களைப் பயன்படுத்தும் போது ToLCCeV நோயால் பாதிக்கப்பட்ட தக்காளி மாதிரிகளில் ~ 200 bp ஆம்பிளிகான்கள் காணப்பட்டன. மேலும், வெவ்வேறு அனீலிங் வெப்பநிலைகளில் பேண்ட் அளவு மற்றும் பட்டைகளின் தீவிரம் ஆகியவற்றில் எந்த வித்தியாசமும் இல்லை. வடிவமைக்கப்பட்ட ப்ரைமர்களின் சரிபார்ப்பு செய்யப்பட்டது, ஆனால் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட சில தக்காளி மாதிரிகளுக்கு மட்டுமே, எனவே வடிவமைக்கப்பட்ட ப்ரைமர்களின் தனித்தன்மையை தீர்மானிக்க மேலும் சரிபார்ப்பு செய்யப்பட வேண்டும். RFLP பகுப்பாய்வு, EcoRI என்ற கட்டுப்பாட்டு நொதியானது ToLCPV, ToLCCeV மற்றும் ToLCMiV ஆகியவற்றை வேறுபடுத்திக் காட்ட முடியும் என்று காட்டியது, ஏனெனில் இது பெகோமோவைரஸ் இனத்திற்கு வெவ்வேறு எண்ணிக்கையிலான பட்டைகளை உருவாக்குகிறது .