உயிர் வேதியியல் & பகுப்பாய்வு உயிர்வேதியியல்

சுருக்கம்

லெஜியோனெல்லா நிமோபிலா முர்பி ரிடக்டேஸின் டோக்கிங் மற்றும் மாலிகுலர் டைனமிக் சிமுலேஷன்ஸ் ஃபார் பொட்டன்ஷியல் இன்ஹிபிட்டர் டிசைனுக்கான

வாணி பிரியதர்ஷினி, திப்யபாபா பிரதான், மன்னே முனிகுமார், அமினேனி உமாமகேஸ்வரி, டி ராஜசேகர் மற்றும் பிவிஎல்என் சீனிவாச ராவ்

Legionella pneumophila என்பது Legionnaires நோய், நிமோனியா மற்றும் உயிருக்கு ஆபத்தான செயற்கை வால்வு எண்டோகார்டிடிஸ் ஆகியவற்றிற்கு காரணமான உயிரினமாகும். உயிரணுச் சுவரின் ஒரு அங்கமான பெப்டிடோக்ளிகானின் உயிரியக்கச் சேர்க்கைக்கான முக்கியமான நொதிகளில் ஒன்றான MurB ரிடக்டேஸ், லெஜியோனெல்லா நிமோபிலா உட்பட தொற்று எண்டோகார்டிடிஸை ஏற்படுத்தும் பாக்டீரியா நோய்க்கிருமிகளுக்கு எதிரான பொதுவான மருந்து இலக்காக அடையாளம் காணப்பட்டது. FAD உடனான MurB ரிடக்டேஸ் ஒரு இணை காரணியாக செயல்படுகிறது மேலும் UDP-N-acetylenolpyruvylglucosamine (UDP-GlcNAcEP) ஐ UDP-N-அசிடைல்முராமிக் அமிலமாக NADPH-சார்ந்த குறைப்பை ஊக்குவிக்கிறது. தற்போதைய ஆய்வில், மேஸ்ட்ரோ v9.2 இன் மெய்நிகர் ஸ்கிரீனிங் பணிப்பாய்வுகளில் செயல்படுத்தப்பட்ட Glide v5.7 இன் தொடர் நெறிமுறையைப் பயன்படுத்தி, FAD இன் 360 கட்டமைப்பு ஒப்புமைகள், Legionella pneumophila இன் MurB ரிடக்டேஸுடன் இணைக்கப்பட்டன. டாக்கிங் பகுப்பாய்வின் மூலம் பெறப்பட்ட ஏழு லீட்களில், கோஃபாக்டர் FAD (XPGscore -13.25Kcal/mol) உடன் ஒப்பிடும்போது, ​​லீட்1 (XPGscore -13.27Kcal/mol) மட்டுமே MurB ரிடக்டேஸுடன் சிறந்த பிணைப்பு உறவைக் கொண்டிருப்பதைக் காண முடிந்தது. MurB ரிடக்டேஸ்-லீட்1 நறுக்குதல் வளாகத்தின் மூலக்கூறு நிலை இடைவினைகள் MurB ரிடக்டேஸ்-FAD வளாகத்துடன் நல்ல தொடர்பைக் காட்டியது. மேலும், MurB ரிடக்டேஸ் - லீட்1 நறுக்குதல் வளாகத்திற்கான மூலக்கூறு டைனமிக் சிமுலேஷன்கள் டெஸ்மண்ட் v3.0 ஐப் பயன்படுத்தி வெவ்வேறு கால அளவுகளில் கரைசலில் உள்ள நறுக்குதல் வளாகத்தின் இயற்கையான இயக்கவியல் மீது வெளிச்சம் போடப்பட்டது. MurB ரிடக்டேஸ் - லீட்1 காம்ப்ளக்ஸ் இன் மூலக்கூறு மாறும் உருவகப்படுத்துதல்கள் நறுக்குதல் இடைவினைகளின் நிலையான தன்மையைக் காட்டியது.