ஜர்னல் ஆஃப் கார்சினோஜெனிசிஸ் & மியூட்டாஜெனெசிஸ்

சுருக்கம்

பெருங்குடல் மலக்குடல் புற்றுநோய் கட்டி உயிரணுக்களின் மரபணு வெளிப்பாடு மெட்டா பகுப்பாய்வு டூமோரிஜெனெசிஸுடன் தொடர்புடைய மரபணுக்களை வெளிப்படுத்துகிறது

ருத்வி வாஜா

பின்னணி: ஒவ்வொரு ஆண்டும், 12 மில்லியனுக்கும் அதிகமான மக்கள் பெருங்குடல் புற்றுநோயால் (CRC) கண்டறியப்படுகிறார்கள், மேலும் 600,000 க்கும் அதிகமானோர் அதிலிருந்து இறக்கின்றனர், இது புற்றுநோயின் இரண்டாவது மிக ஆபத்தான வடிவமாக மாறுகிறது. இந்த வேலை CRC மற்றும் பிற சுரப்பி கட்டி மாதிரிகள் முழுவதும் வேறுபட்ட மரபணு வெளிப்பாட்டை பகுப்பாய்வு செய்கிறது. சிஆர்சி டூமோரிஜெனெசிஸின் வளர்ச்சிக்கு பங்களிக்கும் வெளிப்பாடு மாற்றங்களை அடையாளம் காண.

முறைகள்: இந்த வேலை நான்கு சிஆர்சி கட்டி மற்றும் பிற 10 சுரப்பிக் கட்டிகளைக் குறிக்கும் 13 மரபணு கையொப்பங்களை வரையறுக்கிறது. ஜீன் செட் செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு (GSEA) இரண்டு CRC கையொப்பங்களைப் பயன்படுத்தி GSEA- அடையாளம் காணப்பட்ட முன்னணி-முனை மரபணுக்களிலிருந்து நேர்மறை மற்றும் எதிர்மறை CRC மரபணு பேனல்களை வரையறுக்கப் பயன்படுகிறது. இரண்டு சுயாதீன CRC மரபணு கையொப்பங்களில் CRC பேனல்களின் செறிவூட்டல் மற்றும் முன்னணி-முனை மரபணு உறுப்பினர்களை சரிபார்க்க GSEA பின்னர் பயன்படுத்தப்படுகிறது. பகுப்பாய்வு நான்கு தனிப்பட்ட மற்றும் 10 சுரப்பி கட்டி கையொப்பங்களுக்கு நீட்டிக்கப்படுகிறது. சிஆர்சி டூமோரிஜெனெசிஸுடன் தொடர்புடைய மரபணுக்கள், கையொப்பங்கள் முழுவதும் ஜிஎஸ்இஏ-அடையாளம் கொண்ட முன்னணி-விளிம்புகளின் உறுப்பினர்களை வெட்டுவதன் மூலம் கணிக்கப்படுகின்றன.

முடிவுகள்: CRC மரபணு அடையாள கையொப்பங்களுக்கு இடையே குறிப்பிடத்தக்க செறிவூட்டல் காணப்படுகிறது, அதில் இருந்து நேர்மறை (55 மரபணுக்கள்) மற்றும் எதிர்மறை (77 மரபணுக்கள்) CRC பேனல்கள் வரையறுக்கப்படுகின்றன. CRC மரபணு பேனல்கள் மற்றும் சரிபார்ப்பு கையொப்பங்களுக்கு இடையே சீரற்ற அல்லாத குறிப்பிடத்தக்க செறிவூட்டல் காணப்படுகிறது, இதில் 54 மற்றும் 72 குறைவான வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்கள் முன்னணி விளிம்புகளில் பகிரப்படுகின்றன. மற்ற சுரப்பி கட்டி மாதிரிகளை தனித்தனியாகவும் CRC உடன் இணைந்தும் கருத்தில் கொண்டு, இந்த கையொப்பங்களில் குறிப்பிடத்தக்க சீரற்ற செறிவூட்டல் காணப்படுகிறது. CRC பேனலில் இருந்து (SLC25A32, SLC22A3, SLC25A20, SLC36A1, SLC26A3, SLC9A2, SLC4A4 மற்றும் SLC26A2) போன்ற எட்டு கரைப்பான கேரியர் குடும்ப மரபணுக்கள், பெருங்குடல் வகையைப் பொருட்படுத்தாமல், அனைத்து மரபணு கையொப்பங்களிலும் பொதுவாகப் பகிரப்பட்டன.

முடிவு: இந்த மெட்டா பகுப்பாய்வு CRC டூமோரிஜெனெசிஸ் செயல்முறையுடன் தொடர்புடைய மரபணு வெளிப்பாடு மாற்றங்களை அடையாளம் காட்டுகிறது. இந்த மாற்றங்கள் CRC நோயாளிகளுக்கு கிடைக்கக்கூடிய சிகிச்சை சிகிச்சைகளை உருவாக்க பங்களிக்கலாம்.