ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

என்டோரோகோகஸ் ஃபேசியம் CRL1879 இல் உள்ள பாக்டீரியோசின் மரபணுக்களின் ஜீனோம் மைனிங் மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் பகுப்பாய்வு

சுரேஸ் என், பொனாசினா ஜே, ஹெபர்ட் ஈஎம் மற்றும் சாவேத்ரா எல்*

ஒன்பது கைவினைப் பாலாடைக்கட்டிகளில் இருந்து 151 பாக்டீரியா தனிமைப்படுத்தல்களில், என்டோரோகோகஸ் ஃபேசியம் CRL 1879 உணவில் பரவும் நோய்க்கிருமி லிஸ்டீரியா மோனோசைட்டோஜென்களுக்கு எதிராக பாக்டீரியா எதிர்ப்பு செயல்பாட்டைக் காட்டியது. தனிமைப்படுத்தல் செல் ஃப்ரீ சூப்பர்நேட்டண்டில் ஒரு புரோட்டினேஸ் கே-சென்சிட்டிவ் கலவையை உருவாக்கியது. மரபணு பகுப்பாய்வு என்டோரோசின் ஏ, என்டோரோசின் பி, என்டோரோசின் பி, என்டோசின் எஸ்இ-கே4 போன்ற மற்றும் என்டோரின் எக்ஸ் உயிரியக்க மரபணு கிளஸ்டர்கள் இருப்பதை நிரூபித்தது. பயோ-இன்ஃபர்மேடிக்ஸ் கருவிகளைப் பயன்படுத்தி இரண்டு-கூறு பாக்டீரியோசினுக்கான குறியாக்க நியூக்ளியோடைடு வரிசைகள் கண்டறியப்பட்டன, இங்கு என்டோரோசின் CRL1879αβ என்று பெயரிடப்பட்டது. அளவு நிகழ்நேர PCR பகுப்பாய்வு (qRT-PCR) மூலம் அனைத்து பாக்டீரியோசின் மரபணுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் பகுப்பாய்வு ஒவ்வொரு என்டோரோசின் மரபணுவின் படியெடுத்தலை வெவ்வேறு நிலைகளில் வெளிப்படுத்தியது. இறுதியாக, 251 E. ஃபேசியம் பயோ ப்ராஜெக்ட்களில் பாக்டீரியோசின் மரபணுக்கள் விநியோகம் பற்றிய பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டது மற்றும் E. faecium CRL1879 இல் அடையாளம் காணப்பட்டவற்றுடன் ஒப்பிடப்பட்டது. பாக்டீரியோசின் மரபணுக்கள் என்டோரோகோகஸில் பரவலாக விநியோகிக்கப்படுகின்றன என்பதை பாரபட்சமான பகுப்பாய்வு நிரூபித்தது.

ஆறு வகுப்புகள் II மற்றும் ஒரு வகுப்பு III பாக்டீரியோசின்களை உற்பத்தி செய்வதற்கான முழுமையான மரபணு இயந்திரத்துடன் ஒரு கைவினைப் பாலாடைக்கட்டியிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்ட E. ஃபேசியம் திரிபு முதல் நிரூபணம் என்பதால் இந்தத் தாளில் வழங்கப்பட்ட முடிவுகள் ஒரு தனித்துவமான கண்டுபிடிப்பைப் பிரதிபலிக்கின்றன.