ஜர்னல் ஆஃப் பாக்டீரியாலஜி & பாராசிட்டாலஜி

சுருக்கம்

பாக்கிஸ்தானிய மக்கள்தொகையில் வகை குறிப்பிட்ட முதன்மை ஜோடிகளைப் பயன்படுத்தி மல்டிபிளக்ஸ் PCR மூலம் HBV மரபணு வகை மற்றும் பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு

ஜாவேத் இக்பால், அபிதா ராசா மற்றும் ஜாபர் ஜமான் கான் கட்டக்

பின்னணி: ஹெபடைடிஸ் பி வைரஸ் கடுமையான மற்றும் நாள்பட்ட ஹெபடோசெல்லுலர் கார்சினோமாவை ஏற்படுத்துகிறது, இது உலகளவில் 350 மில்லியனுக்கும் அதிகமான மக்களை பாதிக்கும் ஒரு தீவிர உடல்நலப் பிரச்சினையாகும். புவியியல் ரீதியாக, HBV இன் ஒன்பது மரபணு வகைகள் இதுவரை அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன. (ORF P, S, F மற்றும் X) என பெயரிடப்பட்ட நான்கு திறந்த வாசிப்பு பிரேம்கள் ஹெபடோசைட் செல்களை குறிவைக்கும் வகையில் அதை வழங்குகின்றன. கூடுதலாக, HBV இன் வாழ்க்கைச் சுழற்சியில் இருக்கும் தலைகீழ் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் செயல்முறை அடினோவைரஸுடன் ஒப்பிடும்போது நான்கு வரிசை அதிக பிறழ்வு விகிதங்களை ஏற்படுத்தியது. HBV மரபணு வகைகளுக்கு இடையே உள்ள கட்டமைப்பு மற்றும் செயல்பாட்டு வேறுபாடுகள் தீவிரத்தன்மை, சிக்கல்கள், சிகிச்சை மற்றும் வைரஸுக்கு எதிரான தடுப்பூசி ஆகியவற்றிற்கு முக்கிய ஆதாரமாக உள்ளன. ஹெபடைடிஸ் பி மரபணு வகைப்படுத்தல் அதன் மருத்துவ தாக்கங்கள் மற்றும் புவியியல் பரவலை மதிப்பிடுவதற்கு முக்கியமானது, ஆனால் ஹெபடோகார்சினோஜெனீசிஸ் மற்றும் மருத்துவ சிகிச்சைகள் தொடர்பான குறிப்பிட்ட மரபணு குறிப்பான்களை தீர்மானிக்க துணை-மரபணு வகைகள் பயனுள்ளதாக கண்டறியப்பட்டுள்ளன. பாக்கிஸ்தானில், HBV இன் மூலக்கூறு பரிணாம பகுப்பாய்வில் எந்த தகவலும் கிடைக்கவில்லை. எனவே, இங்கு நிலவும் மேலாதிக்க விகாரங்களின் நிறமாலையை மதிப்பிடுவதற்கு ஒரு ஆய்வு மிகவும் தேவைப்பட்டது.

குறிக்கோள்கள்: இந்த ஆய்வு பாகிஸ்தானில் உள்ள மக்களிடையே HBV மரபணு வகைகளின் பரவலைக் கண்டறிவதை நோக்கமாகக் கொண்டது. இந்த ஆராய்ச்சியில், HBV இன் புதிய விகாரங்கள் மற்றும் துணை மரபணு வகைகளைக் கண்டறிய கவனம் செலுத்தினோம். எச்.பி.வி பரவும் நாடுகளில் பாகிஸ்தான் ஒன்றாகும், ஆனால் துணை மரபணு வகைகள் மற்றும் அவற்றின் மறு ஒருங்கிணைப்பு அல்லது நாட்டில் பரவியுள்ள வைரஸின் பைலோஜெனடிக் தொடர்பு பற்றிய தரவு எதுவும் இல்லை. தற்போதைய ஆய்வு இந்தக் கண்ணோட்டத்தில் மேற்கொள்ளப்பட்டது. இந்த ஆய்வு எதிர்கால ஆராய்ச்சியாளருக்கு பாகிஸ்தானில் உள்ள HBV தொடர்பான விகாரங்கள் மற்றும் அதன் மருத்துவ சிகிச்சைகள் பற்றிய வேறு சில அம்சங்களைப் படிக்க உதவும்.

ஆய்வு இடம் மற்றும் காலம்

ஆய்வு வடிவமைப்பு: செப்டம்பர் 2012 முதல் பிப்ரவரி 2014 வரையிலான காலகட்டத்தில் மொத்தம் 450 ஹெபடைடிஸ் பி மேற்பரப்பு ஆன்டிஜென் HBsAg மற்றும் HBV DNA நேர்மறை மாதிரிகள் முதல் படியாக சேகரிக்கப்பட்டு அணு மருத்துவ புற்றுநோயியல் மற்றும் கதிரியக்க சிகிச்சை நிறுவனத்திற்கு [NORI] அனுப்பப்பட்டது. அனைத்து மாதிரிகளும் A முதல் H வரையிலான 8 HBV மரபணு வகைகளுக்கு வகை குறிப்பிட்ட உள்ளமைக்கப்பட்ட PCR ப்ரைமர் ஜோடி முறையின் மூலம் மரபணு வகைப்படுத்தப்பட்டன. நோயாளிகள் அவர்களின் வயது மற்றும் பாலினம் மற்றும் எழுத்துப்பூர்வ ஒப்புதல் (18 வயதுக்கு குறைவாக இருந்தால் பெற்றோரின் ஒப்புதல்) ஆகியவற்றைப் பொருட்படுத்தாமல் தோராயமாகத் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டனர். பெறப்பட்டது. இந்த ஆய்வு நெறிமுறை மறுஆய்வுக் குழுவால் அங்கீகரிக்கப்பட்டது. எங்கள் ஆராய்ச்சியில், பாக்கிஸ்தானிய மக்கள்தொகையில் ஆதிக்கம் செலுத்தும் விகாரத்தைக் கண்டறிய வகை குறிப்பிட்ட ப்ரைமர் நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தியுள்ளோம், மேலும் NCBI தரவுத்தளங்களிலிருந்து பெறப்பட்ட குறிப்பு வரிசைகளுடன் அதன் பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு.

முடிவுகள்: எங்கள் முடிவுகள் வைரஸ் சுமை மற்றும் அடையாளம் காணப்பட்ட மரபணு வகைகளுக்கு இடையே ஒரு நேரடி உறவைக் காட்டியது மற்றும் மரபணு வகை D மிகவும் ஆதிக்கம் செலுத்தும் மரபணு வகை மற்றும் பாகிஸ்தானிய மக்கள்தொகையில் உள்ள அனைத்து மரபணு வகைகளிலும் அதிக விகிதாச்சாரத்தில் நிலவுகிறது என்பதையும் சுட்டிக்காட்டியது. மரபணு வகை A இன் HBV மரபணு வகை நோய்த்தொற்றுகளை B & C, D உடன் B மற்றும் C உடன் கலப்பது அனைத்து மாதிரிகளிலும் 17 சதவிகிதம் ஆகும். முழுமையான நியூக்ளியோடைடு வரிசைகளில் உள்ள வேறுபாடுகளின் அடிப்படையில் வெவ்வேறு HBV விகாரங்களின் துணை மரபணு வகைகள் அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன. நேர்மறையான PCR முடிவுகள் உறுதிப்படுத்துவதற்காக இரண்டு முறை மீண்டும் மீண்டும் செய்யப்பட்டன. மேலும், பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு எங்கள் அறிக்கையிடப்பட்ட வரிசைகள் மற்றும் குறிப்பு வரிசைகளுக்கு இடையில் ஒரு ஹோமோலஜியை வெளிப்படுத்தியது. ஃபைலோஜெனடிக் முறையானது, புவியியல் பகுதிகளில் மரபணு வகைகள்/துணை-மரபணு வகைகள் வேறுபடுகின்றன மற்றும் இனத்துடன் வலுவாக தொடர்பு கொள்கின்றன என்பதைக் காட்டுகிறது.

முடிவு: மரபணு வகை D கண்டறியப்பட்டது மற்றும் எங்கள் ஆய்வில் D1 & D3 இன் துணை மரபணு வகைகளைக் காட்டும் பாகிஸ்தானிய சமூகத்தில் மிகவும் ஆதிக்கம் செலுத்தும் மரபணு வகையாக வெளிவந்துள்ளது. மரபணு வகை A மற்றும் D ஆகியவை ஒன்றோடொன்று இணை-தொற்றுகளாக உள்ளன மற்றும் இரண்டாவது நடைமுறையில் உள்ள மரபணு வகை குழுவாக பங்களிக்கின்றன. கூடுதலாக, பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு புவியியல் பகுதிகளில் மரபணு வகைகள் வேறுபடுகின்றன மற்றும் NCBI இன் குறிப்பு வரிசைகளுடன் வலுவாக தொடர்புபடுத்துகின்றன.