ஸ்டெபானி டோம்
Myotonic dystrophy வகை 1 (DM1) என்பது ஒரு நிலையற்ற CTG ரிப்பீட்டின் விரிவாக்கத்தின் விளைவாகும், இது பொதுவாக தலைமுறைகள் மற்றும் காலப்போக்கில் உடல் திசுக்களில் அதிகரிக்கிறது. CTG மீண்டும் நிகழும் உறுதியற்ற தன்மை மற்றும் DM1 மருத்துவ வெளிப்பாடுகள் மீண்டும் மீண்டும் நிகழ்தலின் நீளம் மற்றும் மீண்டும் மீண்டும் வரிசையின் தூய்மை ஆகியவற்றைப் பொறுத்தது. CTG விரிவாக்கத்தின் அளவு மற்றும் தூய்மையை தீர்மானிப்பதில் மிகவும் மாறுபட்ட மருத்துவ விளக்கக்காட்சி மற்றும் தொழில்நுட்ப சிக்கல்கள் காரணமாக DM1 இல் உள்ள மரபணு ஆலோசனை மிகவும் சிக்கலானது. பெரிய CTG ரிப்பீட் அளவை துல்லியமாக அளவிட PacBio ஒற்றை-மூலக்கூறு நிகழ்நேர வரிசைமுறை (SMRT) ஐப் பயன்படுத்தினோம் மற்றும் DM1 நோயாளிகளின் மருத்துவ மற்றும் மரபணு மாறுபாட்டைப் புரிந்து கொள்ள விரிவாக்கப்பட்ட அலீலின் வரிசை குறுக்கீடுகளை அடையாளம் கண்டோம். 130 முதல் > 1000 CTG ரிப்பீட்கள் வரை CTG ரிப்பீட் விரிவாக்கம் கொண்ட பல DM1 நோயாளிகளை, சுத்திகரிக்கப்பட்ட ஆம்பிளிகான்களில் இருந்து தொடர் I மற்றும் II அமைப்புகளில் வரிசைப்படுத்தினோம். ஒரு மாதிரிக்கு 77% முழு DM1 ரீட்களை நாங்கள் பெற்றுள்ளோம், > 70% ரீட்களை விரிவாக்கப்பட்ட அல்லீல்களிலிருந்து பெற்றுள்ளோம். 1000 க்கும் மேற்பட்ட CTG ரிப்பீட்டைக் கொண்ட DM1 நோயாளிகள் உட்பட அனைத்து மாதிரிகளுக்கும் எதிர்பார்க்கப்படும் அளவு வரம்பில் நீண்ட வாசிப்புகளை தரவு உள்ளடக்கியுள்ளது (அட்டவணை 1 மற்றும் Ref1). SMRT வரிசைமுறை பெரிய மும்மடங்கு விரிவாக்கங்களை வரிசைப்படுத்தவும், CTG மீண்டும் மீண்டும் குறுக்கீடுகளை அடையாளம் காணவும் மற்றும் DM1 நோயாளிகளில் சோமாடிக் மொசைசிசத்தை மதிப்பிடவும் மிகவும் உறுதியளிக்கிறது. இந்த முறை நோயாளிகளுக்கு வழங்கப்படும் முன்கணிப்பு மற்றும் ஆலோசனையை கணிசமாக மேம்படுத்த முடியும்.