உயிர் வேதியியல் & பகுப்பாய்வு உயிர்வேதியியல்

சுருக்கம்

Human.miRFFL.DB: மனித miRNA கோரெகுலேட்டரி நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் அசோசியேட்டட் ரெகுலேட்டரி-சர்க்யூட்களுக்கான ஒரு க்யூரேட்டட் ரிசோர்ஸ்

பங்கஜ் குரானா*, ராஜீவ் வர்ஷ்னி, ஆர் சுகதேவ்

மரபணு ஒழுங்குமுறை ஒரு சிக்கலான செயல்முறையாக பார்க்கப்படுகிறது, அங்கு ஒழுங்குமுறை கூறுகள் மற்றும் அவற்றின் இலக்குகள் மிகவும் சிக்கலான பிணைய தொடர்புகளை உருவாக்குகின்றன, இதனால் சாதாரண உயிரியல் உடலியல் மற்றும் நோய்-தொடக்கம் மற்றும் முன்னேற்றம் ஆகியவற்றை பாதிக்கிறது. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் (டிஎஃப்) மற்றும் மைக்ரோஆர்என்ஏ (மைஆர்என்ஏ) ஆகியவை முக்கியமான உயிரியல் செயல்முறைகளைக் கட்டுப்படுத்தும் மரபணு வெளிப்பாட்டின் அடிப்படை டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் மற்றும் பிந்தைய டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் கட்டுப்பாட்டாளர்கள். சமீபத்திய ஆண்டுகளில், பல உயர் செயல்திறன் ஆய்வுகள் சிக்கலான ஒழுங்குமுறை இடைவினைகள் மைஆர்என்ஏ மற்றும் டிஎஃப் ஆகியவற்றுக்கு இடையேயான சிக்கலான இடைவினையால் ஒரு இலக்கு மரபணுவை (டிஜி) கட்டுப்படுத்துகிறது என்பதை வெளிப்படுத்தியது. மைஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் டிஎஃப்கள் ஒன்றையொன்று ஒழுங்குபடுத்துவதாக அறியப்படுகிறது. இந்த சிக்கலான கோரெகுலேட்டரி பொறிமுறையானது miRNA:TF:TG கோரெகுலேட்டரி நெட்வொர்க் வடிவில் குறிப்பிடப்படலாம். இந்த நெட்வொர்க் ரெகுலேட்டரி-சர்க்யூட்ஸ் எனப்படும் பல சிறிய தொடர்ச்சியான துணை வரைபடங்களை அடையாளம் காண பயன்படுத்தப்படலாம். இந்த ஒழுங்குமுறை-சுற்றுகளில் ஒன்று Feed-Forward Loops (FFLs) என்றும் அழைக்கப்படும் மூன்று முனை வடிவமாகும், இது ஒரு miRNA மற்றும் TF ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது, இதில் ஒன்று மற்றொன்றைக் கட்டுப்படுத்துகிறது மற்றும் இரண்டும் கூட்டாக ஒரு TG ஐ ஒழுங்குபடுத்துகிறது. இந்த ஒழுங்குமுறை-சுற்றுகள் பல உடலியல் மற்றும் நோயியல் நிலைமைகளின் போது மரபணு ஒழுங்குமுறையின் சிக்கலான இடைவெளியை தெளிவுபடுத்துவதில் பயனுள்ளதாக நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளன.

Human.miRFFL.DB என்பது மனித miRNA:TF:TG கோரெகுலேட்டரி இயக்கிய நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் அவற்றுடன் தொடர்புடைய ஒழுங்குமுறை-சுற்றுகளுக்கான விரிவான ஒருங்கிணைந்த வளமாகும். இரண்டு வகையான FFL மையக்கருத்துக்களை அதாவது miRNA-FFL மற்றும் TF-FFL ஆகியவற்றை அடையாளம் காண வரைபடக் கோட்பாட்டின் அடிப்படையிலான இன்-ஹவுஸ் ஸ்கிரிப்டுகள் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. தரவுத்தளமானது இணை ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் தொடர்புடைய FFLகளின் ஊடாடும் காட்சிப்படுத்தலை வழங்குகிறது. Human.miRFFL.DB ஆனது மனித miRNA:TF:TG கோரெகுலேட்டரி நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் இந்த ஒழுங்குமுறை உயிரி மூலக்கூறுகளின் சிக்கலான செல்லுலார் இடைவினைகளை மறைகுறியாக்க தொடர்புடைய FFL களுக்கான விரிவான தயார் குறிப்புகளாகப் பயன்படுத்தப்படலாம். Human.miRFFL.DB ஆன்லைனில் http:// mirffldb.in/human/ இல் கிடைக்கிறது