Single Cell Biology

சுருக்கம்

LCM- புரோட்டியோமிக்ஸ் பகுப்பாய்வைப் பயன்படுத்தி தக்காளி மைக்ரோஸ்போர்களில் வெப்பத்தால் தூண்டப்பட்ட புரோட்டியோம்களை அடையாளம் காணுதல்

Li H, Zhu Y, Rangu M, Wu X, Batti S, Zhou S, Yang Y, Fish T மற்றும் தன்ஹவுசர் TW

மகரந்த வளர்ச்சி வெப்ப அழுத்தத்திற்கு (HS) மிகவும் எளிதில் பாதிக்கப்படுகிறது மற்றும் தவிர்க்க முடியாத மகரந்தத்தின் உற்பத்தி தாவரங்களில் விதை மற்றும் பழங்கள்-செட் குறைவதற்கு காரணமாகிறது. இந்த ஆய்வு எச்எஸ்-தூண்டப்பட்ட மகரந்தப் புரதங்கள் மற்றும் தக்காளியில் (சோலனம் லைகோபெர்சிகம்) தொடர்புடைய உயிரியல் செயல்முறைகளை அடையாளம் காண மேற்கொள்ளப்பட்டது. தக்காளி 'மைக்ரோ-டாம்' செடிகள் வெப்ப சிகிச்சைக்காக இரண்டு வாரங்களுக்கு 32°C//22°C (பகல்/இரவு, 12/12 மணி) கீழ் அடைகாக்கப்பட்டது, மேலும் சிகிச்சை அளிக்கப்படாத கட்டுப்பாட்டு ஆலைகள் அதே காலத்திற்கு அடைகாத்தன. 25°C /22°C. 5 மிமீ நீளமுள்ள மலர் மொட்டுகளில் வெப்ப உணர்திறன் அணுக்கரு இல்லாத மைக்ரோஸ்போர்ஸ் இருப்பது உறுதி செய்யப்பட்டது. மகரந்த செல்கள் லேசர் கேப்சர் மைக்ரோடிசெக்ஷன் (எல்சிஎம்) பயன்படுத்தி அறுவடை செய்யப்பட்டது மற்றும் உயர் அழுத்தம் மற்றும் வெற்றிடத்தின் கீழ் ஒரு-படி முறையைப் பயன்படுத்தி புரதம் பிரித்தெடுக்கப்பட்டது. தோராயமாக 60,000 LCM அறுவடை செய்யப்பட்ட மைக்ரோஸ்போர் செல்கள் சுமார் 18-20 μg புரதங்களை அளித்தன. டேன்டெம் மாஸ் டேக்குகள் (TMT) புரோட்டியோமிக்ஸ் பகுப்பாய்வு மொத்தம் 6018 புரதங்களை அடையாளம் கண்டுள்ளது, 4784 புரதங்கள் அளவிடப்பட்டன, 37 புரதங்கள் HS மேல்-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட கணிசமாக மாற்றப்பட்ட புரதங்கள் (SCPs) மற்றும் 83 புரதங்கள் HS கீழே (dn)-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட SCPகளாக அடையாளம் காணப்பட்டன. ஆலை MetGenMap அமைப்பைப் பயன்படுத்தி மேலும் ஆய்வு செய்ததில், HS உயர்-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட SCPகள் வெப்பப் பழக்கம், மகரந்தச் சுவர் உருவாக்கம், புரத மடிப்பு/மறுமடிப்பு ஜீன் ஆன்டாலஜி (GO) உயிரியல் செயல்முறைகள் மற்றும் HS dn-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட SCPகள் கார்போஹைட்ரேட்டில் வைக்கப்பட்டுள்ளன. கேடபாலிசம் மற்றும் டி-நோவோ புரத உயிரியக்கவியல் GO விதிமுறைகள். மைட்டோசிஸ், ஆக்ஸிஜனேற்ற அழுத்தங்களுக்கு எதிர்ப்பு, மற்றும் கார்போஹைட்ரேட் மற்றும் லிப்பிட் வளர்சிதை மாற்ற செயல்முறைகள் போன்ற உயிரியல் செயல்முறைகள் HS up- மற்றும் dn-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட SCPகள் இரண்டையும் கொண்டிருக்கின்றன. HS-தூண்டப்பட்ட மகரந்த புரதங்களை அடையாளம் காண்பதில் LCM-TMT புரோட்டியோமிக்ஸ் பணிப்பாய்வு மிகவும் திறமையானது என்பதை இந்த முடிவுகள் குறிப்பிடுகின்றன. இந்த HS தூண்டப்பட்ட SCPகள் தக்காளி மகரந்தங்களின் வெப்ப சகிப்புத்தன்மையை ஆய்வு செய்ய பயன்படுத்தப்படும். PXD010218 அடையாளங்காட்டியுடன் ProteomeXchange மூலம் புரோட்டியோமிக்ஸ் தரவு கிடைக்கிறது.