நுண்ணுயிர் & உயிர்வேதியியல் தொழில்நுட்ப இதழ்

சுருக்கம்

டிரைக்கோடெர்மா எஸ்பிபியின் அடையாளம். டிஎன்ஏ பார்கோடு மற்றும் செல்லுலோலிடிக் செயல்பாட்டிற்கான ஸ்கிரீனிங் மூலம்

அப்தெல்மெகிட் ஐ ஃபஹ்மி, ராகா ஏ ஈசா, கலீல் ஏ எல்-ஹல்ஃபாவி, ஹனாஃபி ஏ ஹம்சா மற்றும் மஹ்மூத் எஸ் ஹெல்வா

எகிப்தின் நைல் டெல்டாவின் வெவ்வேறு இடங்களிலிருந்து டிரைக்கோடெர்மாவின் தனிமைப்படுத்தப்பட்ட இனங்கள் அடையாளம் காணப்பட்டது மற்றும் அவற்றின் செல்லுலோலிடிக் செயல்பாடுகள் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன. உருவவியல் பண்புகளின் அடிப்படையில், 75% தனிமைப்படுத்தல்கள் இனங்கள் நிலைக்கு அடையாளம் காணப்பட்டன, மேலும் அவை நான்கு மொத்த குழுக்களாக பிரிக்கப்பட்டன. டிரைக்கோடெர்மா இனங்களை துல்லியமாக அடையாளம் காண உருவவியல் தன்மை மட்டும் போதுமானதாக இல்லை, ஏனெனில் அவை ஒப்பீட்டளவில் சில உருவவியல் தன்மைகள் மற்றும் வரையறுக்கப்பட்ட மாறுபாடுகளைக் கொண்டுள்ளன, அவை ஒன்றுடன் ஒன்று மற்றும் தனிமைப்படுத்தல்களை தவறாக அடையாளம் காணும். எனவே, உருவவியல் குணாதிசயத்தின் வரம்புகளை ஈடுசெய்ய ஒரு மூலக்கூறு நுட்பத்தைப் பயன்படுத்த வேண்டிய அவசியம் இருந்தது. 5.8S-ITS பகுதியின் DNA வரிசைமுறையானது குறிப்பிட்ட ITS1 மற்றும் ITS4 ஐப் பயன்படுத்தி மேற்கொள்ளப்பட்டது. BLAST நிரலைப் பயன்படுத்தி GenBank இல் டெபாசிட் செய்யப்பட்ட வரிசைகளுடன் 5.8S-ITS பகுதியின் வரிசைகளை ஒப்பிடுவதன் மூலம் அனைத்து தனிமைப்படுத்தல்களும் குறைந்தபட்சம் 99% ஹோமோலஜி சதவீதத்துடன் இனங்கள் நிலைக்கு அடையாளம் காணப்படலாம். கூடுதலாக, ஜென்பேங்கின் நம்பகத்தன்மையை மதிப்பிட TrichOKEY தேடல் கருவி பயன்படுத்தப்பட்டது மற்றும் முடிவுகள் BLAST முடிவுகளுடன் 92% உடன்பாட்டில் இருந்தன. தரவு குறுகிய இனங்களின் பன்முகத்தன்மையைக் குறிக்கிறது மற்றும் இரண்டு முக்கிய இனங்கள் ஆதிக்கம் செலுத்துகின்றன. டி. லாங்கிபார்சியாட்டம் மற்றும் டி.ஹார்சியானம். நியூக்ளியோடைடுகளின் விநியோகம், அத்துடன் (ஜி+சி) ஐசோலேட்டுகளின் ITS பகுதியில் உள்ள உள்ளடக்கம், பலதரப்பட்ட இனங்களின் மாறுபாட்டைக் குறிக்கிறது. இறுதியாக, தனிமைப்படுத்தல்கள் செல்லுலோஸ்-அஸூர் முறையைப் பயன்படுத்தி அவற்றின் மொத்த செல்லுலேஸ் செயல்பாடுகளுக்காகவும், அவிசெல் முறையைப் பயன்படுத்தி எக்ஸோகுளூகேனேஸ் செயல்பாடுகளுக்காகவும், கார்பாக்சிமெதில் செல்லுலோஸ் (சிஎம்சி) மற்றும் அமிலம் வீங்கிய செல்லுலோஸ் முறைகளைப் பயன்படுத்தி எண்டோகுளுகேனேஸ் செயல்பாடுகளுக்காகவும் மதிப்பிடப்பட்டன. இதன் விளைவாக, செல்லுலோலிடிக் திறனுக்காகப் பயன்படுத்தப்படும் 28 தனிமைப்படுத்தல்களில் பதினொரு தனிமைப்படுத்தல்கள் சிறந்த தனிமைப்படுத்தல்களாகத் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டன.