ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

டெங்கு வைரஸ் உட்பட ஃபிளவி வைரஸ் மரபணுக்களில் மீண்டும் மீண்டும் வரும் தொடர்களின் Imex அடிப்படையிலான பகுப்பாய்வு

சௌத்ரி மஷ்ஹுத் ஆலம், ஆசிப் இக்பால், பபிதா தாதாரி மற்றும் சப்தர் அலி

சிம்பிள் சீக்வென்ஸ் ரிபீட்ஸ் (எஸ்.எஸ்.ஆர்), மைக்ரோசாட்லைட்டுகள் என்றும் அழைக்கப்படும், 1-6 நியூக்ளியோடைடுகள் ரிபீட் மோட்டிஃப் ஆகும், இது புரோகாரியோட்டுகள், யூகாரியோட்டுகள் மற்றும் வைரஸ்களின் குறியீட்டு மற்றும் குறியீட்டு அல்லாத பகுதிகளில் வெவ்வேறு எண்ணிக்கையிலான மறு செய்கைகளில் உள்ளது. தற்போதைய ஆய்வு, டெங்கு வைரஸை உள்ளடக்கிய 27 ஃபிளவி வைரஸ் மரபணுக்களில் உள்ள எளிய வரிசைமுறைகளில் (SSRs) கவனம் செலுத்துகிறது. SSRகளின் வெளிச்சத்தில் உள்ள ஒப்பீட்டு வைரஸ் மரபியல், புதிய ஹோஸ்ட்களுக்கு பன்முகத்தன்மை மற்றும் தகவமைப்புத் தன்மையைப் புரிந்துகொள்ள உதவும். 27 ஆய்வு செய்யப்பட்ட மரபணுக்களிலிருந்து மொத்தம் 1164 எஸ்எஸ்ஆர்கள் மற்றும் 53 சிஎஸ்எஸ்ஆர்கள் கண்டறியப்பட்டன. மோனோநியூக்ளியோடைடு A ஆனது, சராசரியாக சுமார் 6 பரவலுடன் கூடிய மிகவும் பரவலாக மீண்டும் மீண்டும் மையமாக இருந்தது. இதைத் தொடர்ந்து G (சராசரி விநியோகம் 2) ஆனது. டைனுக்ளியோடைடுகளில் ஏஜி/ஜிஏ ரிப்பீட் மோட்டிஃப் என்பது ஆய்வு செய்யப்பட்ட மரபணுக்களில் சராசரியாக 14 விநியோகத்துடன் மிகவும் பரவலாக இருந்தது. Flavivirus மரபணுக்களில் மரபணு பரிணாமத்திற்குக் காரணமான இரண்டு அத்தியாவசிய அம்சங்கள் இல்லை, டைனுக்ளியோடைடு ரிபீட் மோட்டிஃப் AT/TA (குறைந்தபட்சம் சராசரியாக ~0.5 விநியோகம்) மற்றும் cSSR குறியீடு அல்லாத பகுதிகளில், இதுவரை விவரிக்கப்படாத வழிமுறைகளால் நிலையான மரபணு அல்லது பரிணாமத்தை பரிந்துரைக்கிறது. டெங்கு வைரஸின் தனிமைப்படுத்தப்பட்ட பகுதிகளில் பாதுகாக்கப்பட்ட வரிசைகளை வெளியிடுவது வைரஸ் நோய் கண்டறிதலுக்கான பயோமார்க்கர் வளர்ச்சிக்கான அடிப்படையை பரிந்துரைக்கிறது.