ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

mBLAST: (மெட்டா) ஜீனோம் பகுப்பாய்விற்கான வரிசைமுறை வெடிப்பைத் தொடர்வது

கர்டிஸ் டேவிஸ், கார்த்திக் கோட்டா, வெங்கட் பால்தண்டபானி, வெய் காங், சாஹர் அபுபக்கர், எரிக் பெக்கர், ஜான் மார்ட்டின், கிறிஸ்டின் எம். வைலி, ராதிகா கெடானி, மேத்யூ ஈ. ஹட்சன், ஜார்ஜ் எம். வெயின்ஸ்டாக் வெயின்ஸ்டாக் மற்றும் மகேடோங்கா மித்ரேவா

அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை தொழில்நுட்பங்களில் சமீபத்திய முன்னேற்றங்களுக்கு சீரமைப்பு அல்காரிதம்களும் மென்பொருள்களும் தேவைப்படுகின்றன, அவை உயர்தர தரவு உற்பத்தியுடன் வேகத்தைத் தொடரலாம். நிலையான வழிமுறைகள், குறிப்பாக புரத ஒற்றுமை தேடல்கள், பகுப்பாய்வு பைப்லைன்களில் குறிப்பிடத்தக்க இடையூறுகளைக் குறிக்கின்றன. குறிப்பாக மெட்டஜெனோமிக் அணுகுமுறைகளுக்கு, பெரிய தரவுத்தளங்களுக்கு எதிராக நூற்றுக்கணக்கான மில்லியன் வரிசை வாசிப்புகளைத் தேடுவது இப்போது அவசியமாகிறது. அடிப்படை உள்ளூர் சீரமைப்பு தேடல் கருவி (BLAST) மற்றும் BLAST இன் உயர் உணர்திறனைத் தக்கவைத்துக்கொள்வதன் அடிப்படையில் பெரிய தரவுத்தொகுப்புகளுக்கு மொழிபெயர்க்கப்பட்ட மற்றும்/அல்லது புரதச் சீரமைப்புகளுக்கான துரிதப்படுத்தப்பட்ட தேடல் அல்காரிதமான mBLASTஐ இங்கு விவரிக்கிறோம். mBLAST அல்காரிதம்கள், பெரிய தரவுத்தொகுப்புகளுக்கான தேசிய உயிரி தொழில்நுட்ப தகவல் மையத்தின் (NCBI) நிரல்களான BLASTX, TBLASTX மற்றும் BLASTP ஆகியவற்றில் கணிசமான வேகத்தை அடைகிறது, இது நிலையான கணினி கட்டமைப்புகளில் நியாயமான காலக்கெடுவுக்குள் பகுப்பாய்வு செய்ய அனுமதிக்கிறது. இந்த கட்டுரையில், mBLAST இன் தாக்கம் மனித நுண்ணுயிர் திட்டத்தில் இருந்து ஆரோக்கியமான மனிதர்களின் மைக்ரோபயோட்டாவிலிருந்து தோன்றும் தொடர்களுடன் நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. குறுகிய வாசிப்புத் தொடர்களை உள்ளடக்கிய மற்றும் உயர்-செயல்திறன் பகுப்பாய்வை உள்ளடக்கிய எந்தவொரு ஆய்வுக்கும் BLASTக்கான செருகுநிரல் மாற்றாக mBLAST வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. mBLAST மென்பொருள் கல்விசார் பயனர்களுக்கு www.multicorewareinc.com இல் இலவசமாகக் கிடைக்கிறது.