ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

MoDa-A Data Warehouse for Multi-"Omics" தரவு

சுதேஷ்னா குஹா நியோகி, மரியா கிரெஸ்ட்யானினோவா, மிஷா கபுஷெஸ்கி, இப்ராஹிம் எமாம், அல்விஸ் பிரஸ்மா, உகிஸ் சர்கான்ஸ்

உயிரியல் மாதிரிகளில் உள்ள உயிரியல் மூலக்கூறுகளின் (எ.கா. டிரான்ஸ்கிரிப்டுகள், புரதங்கள், வளர்சிதை மாற்றங்கள்) பண்புகளை அதிக செயல்திறன் முறையில் அளவிடுவதற்கான பல்வேறு "ஓமிக்ஸ்" தொழில்நுட்பங்களின் வரம்பு தொடர்ந்து அதிகரித்து வருகிறது. இத்தகைய சோதனைகளின் முடிவுகளை ஒருங்கிணைந்த ஆய்வுக்கு உதவும் தகவல் அமைப்புகள் தேவை. MoDa (மூலக்கூறு தரவுக் கிடங்கு) என்ற அமைப்பை நாங்கள் உருவாக்கியுள்ளோம், இது மூலக்கூறு உயிரியலின் பல்வேறு சோதனை நுட்பங்களின் முடிவுகளைக் கண்டறிவதற்கும் காட்சிப்படுத்துவதற்கும் ஒரு ஒருங்கிணைந்த கட்டமைப்பை வழங்குகிறது. கிடங்கு கட்டமைப்பு பல்வேறு வகையான வடிகட்டுதல் மற்றும் மாதிரிகளின் சிறுகுறிப்புகள், சோதனை முடிவுகள் மற்றும் மரபணுக்கள் மற்றும் பிற மூலக்கூறு நிறுவனங்களின் பண்புகளை வினவுவதற்கு உகந்ததாக உள்ளது. செயல்படுத்தல் பயோமார்ட் தொழில்நுட்பத்தை அடிப்படையாகக் கொண்டது, பல பரிமாணத் தரவைக் கையாளும் மேம்பட்ட வழிமுறைகளுடன். பயனர் இடைமுகம் இணைய அடிப்படையிலான பயன்பாடு ஆகும். ஒவ்வொரு தரவுக் கிடங்கு திட்டத்திற்கும் முக்கியமான கருத்தில் தரவு கையகப்படுத்தல் மற்றும் சுத்தம் செய்தல் ஆகும். கிடங்கில் பதிவேற்றப்பட்ட தரவு சீரானதாகவும், மேலும் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வுகளுக்கு போதுமான அளவு நன்கு விளக்கப்பட்டதாகவும் இருப்பதை உறுதிசெய்ய, மாதிரி மற்றும் ஆராய்ச்சி பொருள் தரவு, சோதனை மெட்டாடேட்டா மற்றும் சோதனை முடிவுகளுக்கான களஞ்சியத்தை நாங்கள் செயல்படுத்தினோம். பயோஎன்டிட்டி ("ஜீன்") பரிமாணத்தில் சேகரிக்கப்பட்ட தரவுகளுக்கு ஒரு சீரான குறிப்பு அமைப்பை வழங்க ஒரு மரபணு மறு-குறிப்பு பைப்லைன் பயன்படுத்தப்பட்டது. வளர்ந்த தரவுக் கிடங்கு உள்கட்டமைப்பு உயர் செயல்திறன் மூலக்கூறு உயிரியல் தொழில்நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தும் கூட்டுத் திட்டங்களுக்கு பயனுள்ளதாக இருக்கும் என்று நாங்கள் எதிர்பார்க்கிறோம்.