ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

நைட்ரிலேஸ்களுக்கான மையக்கரு வடிவமைப்பு

நிகில் சர்மா மற்றும் தேக் சந்த் பல்லா

நைட்ரிலேஸ் நைட்ரைல் வளர்சிதை மாற்ற நொதிகளில் ஒன்றாகும், இது பச்சை வேதியியலில் முக்கியத்துவம் பெற்ற நைட்ரைல்களை தொடர்புடைய அமிலங்களாக மாற்றுவதற்கு ஊக்கமளிக்கிறது. நைட்ரிலேஸ் அடி மூலக்கூறு குறிப்பிட்டதாக இருந்தாலும், அது பரந்த அளவிலான நைட்ரைல்களில் (அலிபாடிக்/நறுமணம்) செயல்படுகிறது, லேசான நீராற்பகுப்பில் அதன் பயன் காரணமாக கவனத்தை ஈர்த்துள்ளது. இதுவரை அறிவிக்கப்பட்ட பெரும்பாலான நைட்ரிலேஸ்கள் நுண்ணுயிர்/தாவர மூலங்களிலிருந்து உடல் ரீதியாக பிரித்தெடுக்கப்பட்டவை. நைட்ரிலேஸ்களுக்கான வரிசைகளை அடையாளம் காண இரண்டு குழுக்களின் மையக்கருத்து வடிவமைக்கப்பட்டது அதாவது அலிபாடிக் நைட்ரிலேஸ் மோட்டிஃப்ஸ் (எம்.டி.எம்.எல்) மற்றும் நறுமண நைட்ரிலேஸ் மோட்டிஃப் (எம்.டி.எம்.ஆர்) ஒவ்வொன்றும் நான்கு மையக்கருத்துகளுடன் குறிப்பாக பாதுகாக்கப்பட்ட வினையூக்கி முக்கோணத்துடன் நைட்ரிலேஸைச் சேர்ந்தவை (குளு-138, எல்ஐஎஸ்-438, 165) குறிப்பானாகப் பயன்படுத்தலாம் நைட்ரிலேஸ். Multiple EM for Motif Elicitation (MEME) ஐப் பயன்படுத்தி பல வரிசை சீரமைப்பு (MSA) செய்வதன் மூலம் பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிகள் அடையாளம் காணப்பட்டன. கைமுறையாக வடிவமைக்கப்பட்ட மையக்கருத்துகள் (MDMகள்) ScanProsite ஆல் சரிபார்க்கப்பட்டது மற்றும் அவற்றின் இருப்பு PRATT, Gblocks மற்றும் MEME ஆகியவற்றால் உறுதிப்படுத்தப்பட்டது. MDMArக்கு எதிரான ScanProsite தேடல் தாவரங்கள், விலங்குகள் மற்றும் நுண்ணுயிரிகளில் இருந்து நறுமண நைட்ரிலேஸின் சில புதிய ஆதாரங்களை வெளிப்படுத்தியது. நைட்ரைல்களுக்கு அவற்றின் அடி மூலக்கூறு தனித்தன்மையை உறுதி செய்வதற்காக தனித்துவமான மையக்கருத்துக்களை அடையாளம் காண்பதைத் தவிர, சில முக்கியமான இயற்பியல் வேதியியல் அளவுருக்கள் மற்றும் நிலை குறிப்பிட்ட அமினோ அமிலங்களைப் படிப்பதன் மூலம் தோராயமாக தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட வரிசைகள் சரிபார்க்கப்பட்டன.