ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

மனித ஹெர்பெஸ் சிம்ப்ளக்ஸ் வைரஸின் டிரிப்ளக்ஸ் கேப்சிட் புரதத்தின் சீரமைப்பு ஒற்றுமை பற்றிய NW அல்காரிதம் மற்றும் ANFIS மாடலிங்

விபன் குமார் சோஹ்பால், அபூர்பா டே மற்றும் அமர்பால் சிங்

மனித ஹெர்பெஸ் சிம்ப்ளக்ஸ் வைரஸின் (HHV) டிரிப்ளெக்ஸ் கேப்சிட் புரதங்களின் உகந்த வரிசை ஒற்றுமை என்பது ஒரு சிக்கலான உயிர் தகவலியல் சிக்கலாகும், இது சீரமைப்பு வழிமுறைகள், மாற்று அணி, இடைவெளி பெனால்டி மற்றும் இடைவெளி நீட்டிப்பு ஆகியவற்றால் கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது. ஒற்றுமைத் தேடலுக்குத் தேவையான சீரமைப்பு ஒற்றுமை மற்றும் பொருத்தமான கணக்கீட்டு அணுகுமுறையை உகந்ததாக மாற்ற, பிறழ்வு மேட்ரிக்ஸின் துல்லியமான தேர்வு தேவைப்படுகிறது. தற்போதைய தாள், PAM மற்றும் Blosum மாற்று மெட்ரிக்குகளுக்கான சீரமைப்பு ஒற்றுமையை மாதிரி மற்றும் உருவகப்படுத்த அடாப்டிவ் நியூரோ-ஃப்ஸி இன்ஃபெரன்ஸ் சிஸ்டம் (ANFIS) அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்துகிறது. HHV-I மற்றும் HHV-II இன் பிறழ்வு அணி மற்றும் வரிசைகள் மாதிரியின் உள்ளீட்டு அளவுருக்களாக எடுத்துக் கொள்ளப்பட்டன. இந்த மாதிரியானது தெளிவற்ற அனுமானம், செயற்கை நரம்பியல் நெட்வொர்க் மற்றும் தெளிவற்ற விதிகளின் தொகுப்பு ஆகியவற்றின் கலவையாகும், இது NW அல்காரிதம் பயன்படுத்தி கணக்கீட்டு பகுப்பாய்விலிருந்து நேரடியாக உருவாக்கப்பட்டுள்ளது. முன்மொழியப்பட்ட மாடலிங் அணுகுமுறையானது, குறிப்பிட்ட நிலைமைகளின் கீழ் கணக்கீட்டு பகுப்பாய்வு மூலம் பெறப்பட்ட கவனிக்கப்பட்ட நடைமுறை முடிவுகளுடன் எதிர்பார்க்கப்படும் முடிவுகளை ஒப்பிடுவதன் மூலம் சரிபார்க்கப்படுகிறது. ANFIS சோதனையின் பயன்பாடு, முன்மொழியப்பட்ட மாதிரியால் கணிக்கப்படும் மாற்று அணியானது 0.5% முக்கியத்துவம் வாய்ந்த சோதனை மதிப்புகளுடன் முழுமையாக உடன்படுகிறது என்பதைக் காட்டுகிறது.