தாவர நோயியல் & நுண்ணுயிரியல் இதழ்

சுருக்கம்

பாலிமரேஸ் மற்றும் கோட் புரோட்டீன் ஜெனரல் கோதுமை மஞ்சள் குள்ள வைரஸில் குறிவைக்கப்பட்டு வகைப்படுத்தப்பட்டது, அமினோ அமிலங்கள் ஜென்பேங்கில் உள்ள குழு உறுப்பினர்களுடன் ஒப்பிடப்பட்டன.

ஹோடா வஜிரி*

எகிப்தில் வளர்க்கப்படும் கோதுமைச் செடிகள் வைரஸ் போன்ற அறிகுறிகளைக் காட்டுகின்றன. கோதுமை மஞ்சள் குள்ளமானது RT-PCR நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி வகைப்படுத்தப்பட்டுள்ளது. ஓபன் ரீடிங் ஃப்ரேமில் (ORF1) அமைந்துள்ள பாலிமரேஸ் மரபணு (P1) மற்றும் ஓபன் ரீடிங் ஃப்ரேமில் (ORF3) அமைந்துள்ள கோட் புரோட்டீன் மரபணுவுக்கு கோதுமை மஞ்சள் குள்ள வைரஸ் (WYDV- PAV) தனிமைப்படுத்தப்பட்ட இரண்டு கோடிங் பகுதிகள் இலக்கு வைக்கப்பட்டன.
ஜென்பேங்கில் உள்ள BYDV-PAV ஐசோலேட்டின் படி இரண்டு செட் குறிப்பிட்ட ப்ரைமர்கள் வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளன. BYDV-PAV இன் எகிப்திய தனிமைப்படுத்தப்பட்ட ORF1 மற்றும் ORF3 இன் DNA துண்டுகள் குளோன் செய்யப்பட்டு வரிசைப்படுத்தப்பட்டன. இந்த வரிசையில் வைரஸ் பாலிமரேஸ் மரபணுவுக்கான முழு நீள ORF1 குறியீட்டு முறை உள்ளது. இது 910 nt நீளம் கொண்டது, 34.67 இன் M(r) உடன் 303 அமினோ அமிலங்களின் கணிக்கப்பட்ட பாலிபெப்டைட் சங்கிலியை குறியாக்குகிறது. மறுபுறம், வைரஸ் கோட் புரதத்திற்கான ORF3 குறியீட்டுக்கான வரிசைத் தரவு, 603 bp நீளம் கொண்டது, 21.96 KDa மூலக்கூறு எடையுடன், 200 அமினோ அமிலங்களைக் கொண்ட கணிக்கப்பட்ட புரதத்தைக் குறியாக்குகிறது. எவ்வாறாயினும், NCBI GenBank இல் கிடைக்கும் தனிமைப்படுத்தல்களுடன் எகிப்திய தனிமைப்படுத்தப்பட்ட Egy-Wz இன் பல வரிசை சீரமைப்புகளை அடிப்படையாகக் கொண்ட பைலோஜெனடிக் ஹோமோலஜி மரம், பாலிமரேஸ் மரபணு 76.5%-99% மற்றும் அமினோடைடு அமிலம் மற்றும் நியூக்ளியோடைடில் 71.6%-93.2% வரிசை அடையாளங்களைப் பகிர்ந்து கொண்டது என்பதை வெளிப்படுத்தியது. 05GG2, PAV 014 மற்றும் PAV014, PAV-Aus முறையே தனிமைப்படுத்துகிறது. மறுபுறம், கோட் புரத மரபணு முறையே அமினோ அமிலம் மற்றும் நியூக்ளியோடைடு மட்டத்தில் 06KM14 மற்றும் 05GG2 ஆகிய இரண்டு தனிமைப்படுத்தல்களுடன் 85.1% -99.5% மற்றும் 89.7% -99.2% வரிசை ஒற்றுமையைக் காட்டியது.