ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

தடயவியல் பயன்பாட்டில் தனிநபர் அடையாளத்திற்கான பாக்டீரியா மாதிரிகளின் மக்கள்தொகை பகுப்பாய்வு

ஜான் பி ஜகுப்சியாக், ஜெஃப்ரி எம் வெல்ஸ், ஜெஃப்ரி எஸ் லின் மற்றும் ஆண்ட்ரூ பி ஃபெல்ட்மேன்

பயோ டிஃபென்ஸ் தயார்நிலையானது, அதிநவீன, அதேசமயம் பயன்படுத்த எளிதான உயிரித் தகவல் கருவிகள் மூலம் மரபணுத் தகவலின் துல்லியமான விளக்கத்தின் அடிப்படையில், உயிரி-அச்சுறுத்தல்களைக் கண்டறிந்து பதிலளிக்கும் திறனுடன் தொடங்குகிறது. நுண்ணுயிர் தடயவியல் நுண்ணுயிர் நோய்க்கிருமி மாதிரிகள் சந்தேகத்திற்குரிய மூலத்திற்கு மீண்டும் கற்பிக்கப்படுவதை மேலும் செயல்படுத்துகிறது. மாதிரி குணாதிசயம் மற்றும் மூலத்திற்குத் திரும்பக் கண்டறியக்கூடியது மாதிரிகளுக்குள் குறிப்பிட்ட இலக்குகளின் மரபணு அடையாளம், தற்போதுள்ள மக்கள்தொகையின் கலவைகளின் விரிவான பகுப்பாய்வு மற்றும் அடையாளம் காணப்பட்ட மரபணுக்களில் பெரிய/சிறிய மாறுபாடுகளைக் கண்டறிதல் மற்றும் பிற மாதிரிகளுடன் மாதிரி மரபணு சுயவிவரத்தை ஒப்பிடுதல் ஆகியவற்றைச் சார்ந்துள்ளது. கமர்ஷியல் நெக்ஸ்ட் ஜெனரேஷன் சீக்வென்சிங் (NGS) இயங்குதளங்கள் தற்போதைய பயன்பாட்டில் உள்ள முறைகளை விட வியத்தகு முறையில் அதிக கண்டறிதல் உணர்திறன் மற்றும் தடயவியல் DNA மாதிரிகளின் தீர்மானத்தை வழங்குகின்றன. இருப்பினும், பாக்டீரியா மாதிரிகளின் தடயவியல் பகுப்பாய்வுகளுக்கு இந்தத் தொழில்நுட்பங்களைப் பயன்படுத்துவதற்கு முன், ஒப்பீட்டு பகுப்பாய்வுகளில் கருதுகோள் சோதனைக்காக NGS இன் நன்மைகள், எச்சரிக்கைகள் மற்றும் ஆபத்துகளை முழுமையாக தெளிவுபடுத்துவது மிகவும் முக்கியமானது, இறுதியில் இது NGS க்கு விசாரணைக் கருவியாகவும் கருவியாகவும் பயன்படுத்தப்பட வேண்டும். நீதிமன்றங்களில் பண்புக்காக. முறைகள்: கலவைகளில் உள்ள மரபணுக்களை அடையாளம் காண நேரடி மாதிரி வரிசைமுறையிலிருந்து மெட்டஜெனோமிக் வரிசைத் தரவை செயலாக்க நாவல் நிகழ்தகவு வழிமுறைகளை நாங்கள் உருவாக்கி மதிப்பீடு செய்தோம். முடிவுகள்: ஒரு நுண்ணுயிரிக்கு அப்பால் விரிவான மாதிரி உள்ளடக்கத்தை வகைப்படுத்துவதற்கு இலக்கு குணாதிசயத்தை மேம்படுத்த, குறிப்பு இல்லாத மாதிரி-க்கு-மாதிரி ஒப்பீடுகளுக்கான பைப்லைனை நாங்கள் வழங்குகிறோம். எங்கள் கருவிகள் மாதிரிகளின் வம்சாவளியைக் கண்டறிய புள்ளிவிவர நம்பிக்கையை வலுப்படுத்துகிறது மற்றும் ஒரு மரபணுவிற்குப் பதிலாக பல இலக்குகளில் நிகழ்தகவு உறுதியுடன் மூலத்திற்கு மாதிரிகளை கற்பிக்கிறது. முடிவு: இந்த ஆய்வு மாதிரிகளில் மரபணு வேறுபாட்டைக் கணக்கிடுவதற்கும் அடையாளம் காண்பதற்கும் ஒரு புதுமையான குறிப்பு இல்லாத, உயிர் தகவலியல் உத்தியை உருவாக்கியது. சீக்வென்சர் இயந்திரப் பிழையின் பின்னணி இரைச்சல் நிலைக்கு மேல் விகிதத்தில் முன்னோக்கி மற்றும் தலைகீழ் வாசிப்பு இரண்டிலும் வரிசை மாறுபாடுகள் தன்னிச்சையாக உறுதிப்படுத்தப்பட வேண்டும். ஒரு ஒற்றுமை தொலைவு அளவீடு மரபணுக்களை அருகிலுள்ள உறவுகளின் வரம்பிற்குள் ஒப்பிடுகிறது. உயிரி-அச்சுறுத்தல் முகவர்களிடமிருந்து வரிசைத் தரவைப் பயன்படுத்தி, அறியப்பட்ட தொடர்புடைய விகாரங்களை வெற்றிகரமாகக் கூறினோம், மேலும் அறியப்பட்ட தொடர்பில்லாத விகாரங்களின் நெருங்கிய தொடர்பை விலக்கினோம். இந்த தடயவியல் முறையின் முக்கிய பலங்கள், தரவு சரிபார்ப்பு மற்றும் தொடர்புடைய அளவீடுகளின் தன்னிச்சையற்ற தீர்மானங்கள், அத்துடன் தொடர்புடைய மரபணுக்களின் குறிப்பு தரவுத்தளத்துடன் அல்லது இல்லாமல் நுண்ணுயிர் மரபணுக்களை ஒப்பிடும் திறன் ஆகும்.