ஜர்னல் ஆஃப் பார்மகோஜெனோமிக்ஸ் & பார்மகோபுரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

5-ஃப்ளோரூராசில் நச்சுத்தன்மையின் கணிப்பு, டைஹைட்ரோபிரிமிடின் டீஹைட்ரோஜினேஸ் ஜீன் (டிபிஒய்டி) பாலிமார்பிஸத்துடன் தொடர்புடைய இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு நிரல்களைப் பயன்படுத்தி

கியோங்கி மகன்

5-ஃப்ளோரூராசில் (5-FU) டைஹைட்ரோபிரிமிடின் டீஹைட்ரோஜினேஸ் (DPD) மூலம் விரைவாக சிதைக்கப்படுகிறது, இது 5-FU மற்றும் பைரிமிடின்களின் கேடபாலிக் பாதையில் முதல் மற்றும் விகிதத்தை கட்டுப்படுத்தும் நொதியாகும். ஒரு DPD-சாதாரண நோயாளிக்கு 5-FU இன் தாங்கக்கூடிய சிகிச்சை டோஸ் DPD-குறைபாடுள்ள நோயாளியை சகிக்க முடியாததாக மாற்றும். உடலின் பிரதிபலிப்பு மற்றும் மருந்துகளுக்கான சகிப்புத்தன்மை ஆகியவற்றில் இந்த தனிப்பட்ட வேறுபாடுகள் மற்றவற்றுடன் டைஹைட்ரோபிரைமிடின் டீஹைட்ரோஜினேஸ் மரபணு (DPYD) சிங்கிள் நியூக்ளியோடைடு பாலிமார்பிஸங்கள் (SNPs) காரணமாக இருக்கலாம். ஒரு நோயாளியின் உயிரையும் பணத்தையும் காப்பாற்ற, மருத்துவப் பரிசோதனைகள் அல்லது 5-FU சிகிச்சைக்கு முன் 5-FU நோயாளியின் சகிப்புத்தன்மையைக் கண்டறிய சுகாதார நிபுணர்களுக்கு வசதியான மற்றும் நம்பகமான வழி தேவை. யாஸ்பின், PSIPRED மற்றும் Jpred 3 ஆகிய இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு நிரல்களைப் பயன்படுத்தி 5-FU க்கு ஒரு தனிநபரின் சகிப்புத்தன்மையின்மையைக் கணிக்க எளிய, எளிதான மற்றும் வேகமான வழியை இங்கு முன்வைக்கிறேன். இந்த திட்டங்கள் DPYD க்குள் பிறழ்வு (கள்) உடன் மற்றும் இல்லாமல் DPD இரண்டாம் கட்டமைப்பை கணிக்கின்றன, இதனால் மனித DPD டொமைன்களின் செயல்பாட்டு தளங்களில் பிறழ்வு-தூண்டப்பட்ட கட்டமைப்பு மாற்றங்களின் தாக்கத்தை குறைக்க முடியும். மாதிரிகளாக பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட 11 SNP களில், DPD டொமைன் V இல் உள்ள D949V (SNP A2846T) மற்றும் C953S (SNP G2858C) ஆகிய இரண்டு தவறான பிறழ்வுகள் [4Fe-4S] க்ளஸ்டர்களுக்குப் பொறுப்பான டொமைன் மையத்தின் இடையூறுகளை ஏற்படுத்தும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. மேலும், டிபிஒய்டியில் பிளவுபடும் பகுதியில் (14 ஜி1ஏயில்) புள்ளி பிறழ்வு துண்டிக்கப்பட்ட டிபிடி எம்ஆர்என்ஏக்கள் (எக்ஸான் 14 ஸ்கிப்பிங்) மற்றும் முடக்கப்பட்ட டிபிடி புரோட்டீன்கள் (டி581 முதல் என்635 வரை 55 அமினோ அமிலங்களைக் காணவில்லை) இது டிபிடி செயல்பாட்டின் முழுமையான இழப்பை ஏற்படுத்தும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. . எக்ஸான் 14 ஸ்கிப்பிங், D949V மற்றும் C953S பிறழ்வு முன்னிலையில் மனித DPDயின் முப்பரிமாண கட்டமைப்புகளில் குறிப்பிடத்தக்க மாற்றத்தை SWISS-MODEL கணித்துள்ளது. எனவே, இந்த இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு திட்டங்களின் கணிப்பு DPYD இல் உள்ள பிறழ்வு (கள்) காரணமாக நச்சுத்தன்மையுடன் தொடர்புடைய 5-FU பற்றிய பயனுள்ள மற்றும் நம்பகமான தகவல்களை வழங்குகிறது.