ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

PICRUSt2 மற்றும் Piphillin பைப்லைன்களைப் பயன்படுத்தி இந்தியாவில் இயற்கையாகவே புளிக்கவைக்கப்பட்ட பால் பொருட்களில் பாக்டீரியாவின் முன்கணிப்பு செயல்பாடு

எச். நகிபாபர் ஜோன்ஸ் ஷாங்ப்லியாங், ஜோதி பிரகாஷ் தமாங்*

இயற்கையாக புளிக்கவைக்கப்பட்ட பால் (NFM) தயாரிப்புகள் இந்திய மாநிலங்களான சிக்கிம் மற்றும் அருணாச்சல பிரதேசத்தில் பிரபலமான உணவு வகைகளாகும். இந்தியாவின் இந்த NFM தயாரிப்புகளில் உள்ள பாக்டீரியா சமூகங்கள் முன்பு உயர்-செயல்திறன் வரிசை முறை மூலம் பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டன. இருப்பினும், இந்தியாவின் NFM தயாரிப்புகளின் முன்கணிப்பு மரபணு செயல்பாடு ஆய்வு செய்யப்படவில்லை. இந்த ஆய்வில், சிக்கிம் மற்றும் அருணாச்சல பிரதேசத்தின் NFM தயாரிப்புகளின் மூல வரிசைகள் MG-RAST/NCBI தரவுத்தள சேவையகத்திலிருந்து அணுகப்பட்டன. நுண்ணுயிர் செயல்பாட்டு மரபணு முன்கணிப்பை ஆய்வு செய்ய PICRUSt2 மற்றும் Piphillin கருவிகள் பயன்படுத்தப்பட்டன. MUSiCC- இயல்பாக்கப்பட்ட KOக்கள் மற்றும் PICRUSt2 மற்றும் Piphillin இரண்டிலிருந்தும் KEGG பாதைகளை வரைபடமாக்கியது, பிந்தையவற்றுடன் ஒப்பிடுகையில் முந்தையவற்றின் அதிக சதவீதத்தை விளைவித்தது. இரண்டு பைப்லைன்களிலிருந்தும் செயல்பாட்டு அம்சங்கள் ஒப்பிடப்பட்டாலும், கணிப்புகளுக்கு இடையே குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் இருந்தன. எனவே, இரண்டு வழிமுறைகளின் ஒருங்கிணைக்கப்பட்ட விளக்கக்காட்சியானது இந்தியாவின் NFM தயாரிப்புகளின் மைக்ரோபயோட்டாவுடன் தொடர்புடைய முன்கணிப்பு செயல்பாட்டு சுயவிவரங்களின் ஒட்டுமொத்த கண்ணோட்டத்தை வழங்கியது.