ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

கன்சர்வேடிவ் கிரேடு மற்றும் ப்ராக்ஸிமேட் கிரேடைப் பயன்படுத்தி புரோட்டீன் செயல்பாட்டு தள கணிப்பு

யோசுகே கோண்டோ மற்றும் சடோரு மியாசாகி*

இதுவரை, ஒரு புரதத்தின் முக்கியமான தளங்களைக் கணிப்பதற்காக, பல கணக்கீட்டு முறைகள் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன. பிக்-டேட்டாவின் சகாப்தத்தில், கட்டமைப்புத் தரவுகளில் வரிசைத் தரவை ஒருங்கிணைப்பதன் மூலம் ஏற்கனவே உள்ள முறைகளின் மேம்பாடுகள் மற்றும் நுட்பங்களுக்கு இது தேவைப்படுகிறது. இந்த தாளில், நாங்கள் இரண்டு விஷயங்களை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளோம்: வரிசை அடிப்படையிலான முறைகளை மேம்படுத்துதல் மற்றும் வரிசை மற்றும் கட்டமைப்பு தரவு இரண்டையும் பயன்படுத்தி ஒரு புதிய முறையை உருவாக்குதல். எனவே, நாங்கள் முதலில் மாற்றியமைக்கப்பட்ட பரிணாம சுவடு முறையை உருவாக்கினோம், இதில் புரோட்டீன்-அயன், புரோட்டீன்-லிகண்ட், புரோட்டீன்-நியூக்ளிக் ஆகியவற்றின் பார்வையில் இருந்து முன்னறிவிக்கப்பட்ட செயலில் உள்ள தளங்களை மதிப்பிடுவதற்காக, கொடுக்கப்பட்ட பல வரிசை சீரமைப்பு மற்றும் ஒரு அருகாமையில் இருந்து கணக்கிடப்பட்ட பழமைவாத தரங்களை வரையறுத்தோம். அமிலம், முப்பரிமாண கட்டமைப்புகளைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் புரதப் புரத தொடர்பு. வேறு வார்த்தைகளில் கூறுவதானால், அருகாமையில் உள்ள தரம் ஒரு அமினோ அமில எச்சத்தை மதிப்பிட முடியும். மொழிபெயர்ப்பு நீட்டிப்பு காரணி Tu/1A புரதங்களுக்கு எங்கள் முறையைப் பயன்படுத்தியபோது, ​​பழமைவாத கிரேடுகள் நெருங்கிய தரத்தால் துல்லியமாக மதிப்பிடப்படுகின்றன என்பதைக் காட்டுகிறது. இதன் விளைவாக, எங்கள் யோசனை இரண்டு நன்மைகளைக் குறிக்கிறது. ஒன்று, மதிப்பீட்டிற்காக பல்வேறு படிக அமைப்புகளை நாம் கணக்கில் எடுத்துக்கொள்ளலாம். மற்றொன்று, கொடுக்கப்பட்ட கன்சர்வேடிவ் கிரேடுக்கும் ப்ராக்ஸிமேட் கிரேடுக்கும் இடையே உள்ள உடற்தகுதியைக் கணக்கிடுவதன் மூலம், சிறந்த பழமைவாத தரத்தை நாம் தேர்ந்தெடுக்கலாம்.