ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

உறுதியான தொடர் மாதிரியைப் பயன்படுத்தி புரோட்டீன் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு கணிப்பு

குவோ-சிங் லியாங் மற்றும் சியாடோங் வாங்

ஒரு புரதத்தின் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பை அதன் அமினோ அமில வரிசையிலிருந்து கணிப்பது அதன் முப்பரிமாண கட்டமைப்பின் கணிப்புக்கு ஒரு முக்கியமான படியாகும். புரோட்டீன் டேட்டா பேங்கில் உள்ள அறியப்பட்ட இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளைக் கொண்ட புரதங்களுடனான ஒற்றுமை மற்றும் ஹோமோலஜியை தற்போதுள்ள பல வழிமுறைகள் பயன்படுத்தினாலும், குறைந்த ஒற்றுமை நடவடிக்கைகளைக் கொண்ட பிற புரதங்களுக்கு அவற்றின் இரண்டாம் கட்டமைப்பைக் கண்டுபிடிப்பதற்கு ஒற்றை வரிசை அணுகுமுறை தேவைப்படுகிறது. இந்தத் தாளில், ஒற்றை-வரிசை புரதம் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு முன்கணிப்புக்கான நிர்ணய வரிசைமுறை மாதிரி முறை மற்றும் மறைக்கப்பட்ட மார்கோவ் மாதிரியின் அடிப்படையில் ஒரு வழிமுறையை நாங்கள் முன்மொழிகிறோம். கணிப்புகள் சாளர கண்காணிப்புகளின் அடிப்படையில் மற்றும் கண்காணிப்பு சாளரத்தில் சாத்தியமான இணக்கங்களின் சராசரி எடையினால் செய்யப்படுகின்றன. முன்மொழியப்பட்ட அல்காரிதம் தற்போதுள்ள ஒற்றை-வரிசை அல்காரிதத்துடன் ஒப்பிடும்போது உண்மையான தரவுத்தொகுப்பில் சிறந்த செயல்திறனை அடைவதாகக் காட்டப்படுகிறது.