ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

PDB பிரபஞ்சத்தின் விரைவான நம்பகமான ஆய்வு ஒரு புதிய டெம்ப்ளேட் தேடல் அல்காரிதம் தேடுகிறது

சுனில் நஹாடா மற்றும் ஆஷிஷ் ருந்தலா

டெம்ப்ளேட் அடிப்படையிலான மாடலிங் (TBM) மூலம் பூர்வீக புரதக் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு பல ஆண்டுகளாக கட்டமைப்பு உயிரியலின் முக்கிய யதார்த்தமான இலக்காக உள்ளது. TBM அல்காரிதம்களுக்கு இலக்கு புரத வரிசையை அதிகபட்சமாக மறைப்பதற்கும் அதன் சரியான இடவியலை உருவாக்குவதற்கும் சிறந்த வார்ப்புருக்கள் தேவைப்படுகின்றன. எவ்வாறாயினும், அத்தகைய முன்கணிப்பு அல்காரிதம்களின் துல்லியமானது எங்கள் டெம்ப்ளேட் தேடல் நடவடிக்கைகளின் அல்காரிதமிக் மற்றும் லாஜிக்கல் சிக்கல்களால் பாதிக்கப்படுகிறது, இது இலக்கு வரிசைக்கான நம்பகமான கட்டமைப்புகளை விரைவாகத் திரையிடத் தவறிவிட்டது. இந்த ஆய்வில், PSI-BLAST மற்றும் HHPred ஆகிய தேடுபொறிகளின் செயல்திறனை மதிப்பிடுவதற்கு CASP10 இலக்கு T0752 மாடல்களைக் கணிக்க, 41,967 டெம்ப்ளேட்களின் PDB95 தரவுத்தொகுப்பை நாங்கள் பயன்படுத்துகிறோம். TBM முன்கணிப்பு முறைகளின் துல்லியத்தை மேம்படுத்த புதிய காட்சிகளைத் திறப்பதற்காக எங்கள் பகுப்பாய்வு ஒரு விரிவான ஆய்வை முன்வைக்கிறது. இது மிகவும் பிரபலமான டெம்ப்ளேட் தேடல் நடவடிக்கைகளின் பலவீனங்களை வெளிப்படுத்துகிறது மற்றும் அதன் மூலம் மிகவும் நம்பகமான டெம்ப்ளேட் தேடல் அல்காரிதத்தின் அவசியத்தை விளக்குவதற்கு முன்னறிவிக்கப்பட்ட டெம்ப்ளேட் தேடல் அல்காரிதத்தின் குணங்கள் பற்றிய குறிப்பிடத்தக்க நுண்ணறிவை சுருக்கமாக வழங்குகிறது.