தாவர நோயியல் & நுண்ணுயிரியல் இதழ்

சுருக்கம்

நிகழ்நேர PCR ஐப் பயன்படுத்தி மண் மற்றும் தாவர மாதிரிகளில் Fusarium udum இன் விரைவான கண்டறிதல் மற்றும் அளவிடுதல்

சுகுமார் மேசபோகு, பண்டமரவுரி கிஷோர் பாபு, அச்சலா பக்ஷி, சோமசானி எஸ். ரெட்டி, சங்கீதா சக்சேனா, அலோக் கே. ஸ்ரீவஸ்தவா மற்றும் திலீப் கே. அரோரா

நிகழ்நேர PCR அடிப்படையிலான கண்டறிதல் மதிப்பீடு Fusarium udum க்காக உருவாக்கப்பட்டது, இது புறாவின் வாஸ்குலர் வாடலை ஏற்படுத்துகிறது. F. udum இன் ஹிஸ்டோன்-3 மரபணு இனங்கள்-குறிப்பிட்ட ப்ரைமர்கள் மற்றும் ஆய்வுகளை வடிவமைக்க இலக்காக இருந்தது. பல்வேறு மாதிரிகளிலிருந்து F. udum ஐக் கண்டறிந்து அளவிடுவதற்கான நம்பகமான மற்றும் மறுஉருவாக்கம் செய்யக்கூடிய செயல்முறையை உருவாக்க ஒரு ஒப்பீட்டு ஆய்வு மேற்கொள்ளப்பட்டது. ஒலிகோநியூக்ளியோடைடுகளின் உணர்திறன் மற்றும் தனித்தன்மை ஆகியவை டாட் பிளட் ஹைப்ரிடைசேஷன், ஸ்டாண்டர்ட் மற்றும் நிகழ்நேர பிசிஆர் மதிப்பீடுகள் மூலம் மதிப்பிடப்பட்டது. HFUSP ஆய்வு, F. udum இன் தூய கலாச்சாரங்களிலிருந்து சுற்றுச்சூழல் DNA மாதிரிகள் வரை பெறப்பட்ட DNAவுக்கான அதிக அளவு உணர்திறனைக் காட்டியது. qPCR மதிப்பீடு F. udum ஐ, Fusarium, பிற சோதனை நுண்ணுயிரிகள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் மாதிரிகள் ஆகியவற்றின் நெருங்கிய தொடர்புடைய இனங்களிலிருந்து குறிப்பாக வேறுபடுத்தியது. 84.17 இல் உள்ள ஒற்றை உருகும் வளைவு மற்றும் 200 bp இன் மோனோமார்பிக் இசைக்குழு PCR மதிப்பீடுகளின் தனித்தன்மை மற்றும் நம்பகத்தன்மையைக் குறிக்கிறது. எனவே, நிகழ்நேர PCR மதிப்பீட்டை ஒரு விரைவான மற்றும் பயனுள்ள செயல்முறையாகப் பயன்படுத்தலாம், இது சிக்கலான சூழல்களில் இருந்து F. udum இன் நிமிட அளவைக் கண்டறிய முடியும். எனவே, தற்போதைய ஆய்வில் நிரூபிக்கப்பட்ட நிகழ்நேர PCR மதிப்பீட்டை, புறாவின் வாஸ்குலர் வாடலின் ஆரம்பகால தொற்று மற்றும் நோய் தொற்றுநோய்க்கு F. udum ஐக் கண்டறிந்து கண்காணிப்பதற்கு வெற்றிகரமாகப் பயன்படுத்தலாம்.