ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

சுருக்கமான வர்ணனை: டிஎன்ஏ-பிணைப்பு விருப்பத்தேர்வுகளின் சி2எச்2-இசட்எஃப் டொமைன்கள் கட்டமைப்பு மாதிரிகளைப் பயன்படுத்தி: மனித சிடிசிஎஃப் மீதான பயன்பாடு

ஆல்பர்டோ மெசேகுயர், ரூபன் மோலினா-ஃபெர்னாண்டஸ், நர்சிஸ் பெர்னாண்டஸ்-ஃப்யூன்டெஸ், ஓரியோல் ஃபோர்ன்ஸ்*, பால்டோ ஒலிவா*

"C2H2-ZF டொமைன்களின் டிஎன்ஏ-பிணைப்பு விருப்பங்களின் முன்கணிப்பில், கட்டமைப்பு மாதிரிகளைப் பயன்படுத்தி: மனித CTCF இல் பயன்பாடு" என்ற தலைப்பில், Cis2-His2 துத்தநாக விரல் (C2H2-ZF) க்கான டிஎன்ஏ-பிணைப்பு விருப்பங்களைக் கணிக்க ஒரு புதிய கணக்கீட்டு முறையை நாங்கள் முன்வைக்கிறோம். ) புரத-களங்கள் அவற்றின் அமினோ அமில வரிசை அல்லது அமைப்பிலிருந்து. அறிவு அடிப்படையிலான புள்ளியியல் ஆற்றல்களின் தொகுப்பைக் கணக்கிடுவதற்கு புரதம்-டிஎன்ஏ வளாகங்களின் கட்டமைப்புகளைப் பயன்படுத்துகிறது. அறியப்பட்ட கட்டமைப்பைக் கொண்ட குறைந்த எண்ணிக்கையிலான புரத-டிஎன்ஏ வளாகங்களைக் கருத்தில் கொண்டு, 170000 க்கும் மேற்பட்ட வரிசை-வடிவமைக்கப்பட்ட C2H2-ZF டொமைன்களின் சோதனை ஈஸ்ட்-ஒன்-ஹைப்ரிட் இடைவினைகள் கொண்ட கட்டமைப்புகளின் தொகுப்பை நாங்கள் கூடுதலாக வழங்குகிறோம். இந்தக் குடும்பத்தின் எந்தவொரு புரத-டிஎன்ஏ வளாகத்தின் கட்டமைப்பையும் மாதிரியாக்குவதற்கும், புள்ளியியல் சாத்தியக்கூறுகளுடன் கணக்கிடப்பட்ட சிறந்த தொடர்புகளின் அடிப்படையில் அதன் தத்துவார்த்த நிலை எடை மேட்ரிக்ஸைப் பெறுவதற்கும் ஒரு சேவையகத்தை நாங்கள் செயல்படுத்தியுள்ளோம். அணுகுமுறை சரிபார்க்கப்பட்டது மற்றும் CTCF இன் மனித வரிசைக்கு பயன்படுத்தப்படுகிறது.