பரம்பரை மரபியல்: தற்போதைய ஆராய்ச்சி

சுருக்கம்

இண்டிகா ரைஸில் உள்ள DREB மரபணுவின் மூலக்கூறு தன்மை பற்றிய ஆய்வுகள் (Oryza sativa L.)

ஜாதாவோ கே.ஆர்., சமல் கே.சி., பிரதான் எஸ்.கே மற்றும் ரூட் ஜி.ஆர்

தானியங்களில் வறட்சிக்கான தகவமைப்பு பதில்களில் ஈடுபட்டுள்ள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் மற்றும் டிரான்ஸ்ஜெனிக் அணுகுமுறைகளால் சாத்தியமான வேட்பாளர் மரபணுக்களின் எண்ணிக்கை (சிஜிக்கள்) அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளது. வறட்சியைத் தாங்கும் தன்மையை வழங்கும் இந்த மரபணுக்களில் ஒன்று DREB மரபணு குடும்பமாகும். DREB மரபணு குடும்பத்தில் உள்ள மரபணு/அலெலிக் மாறுபாட்டை ஆராய்வது மன அழுத்த சகிப்புத்தன்மையை நன்கு புரிந்துகொள்வதற்கான ஒரு முக்கியமான முன்நிபந்தனையாகும். தற்போதைய விசாரணையானது பயிர் மேம்பாட்டுத் திட்டத்திற்குத் தேவைப்படும் பல்வேறு நெல் சாகுபடியின் DREB மரபணுவில் உள்ள நியூக்ளியோடைடு வரிசையில் உள்ள அலெலிக் மாறுபாட்டைப் படிப்பதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. பத்து மலைப்பகுதி மற்றும் தாழ்நில நெல் சாகுபடிகள் மூலக்கூறு தன்மை மற்றும் அலீல் சுரங்கத்திற்காக பயன்படுத்தப்பட்டன. சோதனை செய்யப்பட்ட அனைத்து கிருமிகளிலும் DREB மரபணு கண்டறியப்பட்டு NCBI GenBankக்கு சமர்ப்பிக்கப்பட்டது (அணுகல் எண்கள் KF 545561 to KF 545569). உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு 59 அமினோ அமிலங்களின் AP2 டிஎன்ஏ பிணைப்பு டொமைனுடன் 100 சதவிகித அடையாளத்தைக் காட்டியது, இது 14 வது வாலைன் மற்றும் 19 வது குளுடாமிக் அமிலம் பாதுகாக்கப்பட்ட எச்சங்களுடன் பாதுகாக்கப்பட்ட மூன்று தாள்களைக் காட்டியது. 5.89 kDa மற்றும் ஐசோ-எலக்ரிக் பாயிண்ட் (pI) 10.38 என்ற கணிக்கப்பட்டுள்ள மூலக்கூறு நிறை கொண்ட அலனைன் (17.6%) மற்றும் அர்ஜினைன் (15.7%) அமினோ அமிலங்கள் நிறைந்த DREB புரதத்தின் AP2 டொமைன் காணப்பட்டது. டிஆர்இபி மரபணு நியூக்ளியோடைடு வரிசைகள் டிஎன்ஏ பாலிமார்பிஸம் பகுப்பாய்வு மூலம் சரிபார்க்கப்பட்டது, அவற்றில் 196 மாறாத (மோனோமார்பிக்) மற்றும் 8 மாறி (பாலிமார்பிக்) அதாவது பிரிக்கும் தளங்கள் 9 எண்ணிக்கையிலான பிறழ்வு மற்றும் 5 ஹாப்லோடைப்கள் உட்பட அடையாளம் காணப்பட்டன. ஹாப்லோடைப்ஸ் (மரபணு) பன்முகத்தன்மை 0.756; மாறுபாடு மற்றும் நிலையான விலகல் பன்முகத்தன்மை முறையே 0.01678 மற்றும் 0.130 ஆகும். 'கந்தகிரி' வகை அரிசியின் அனைத்து இணைப்புகளிலும் DREB மரபணுவுடன் 97.5% ஒற்றுமையையும், தரவுத்தளத்தில் உள்ள AK121956 அணுகலுடன் 0.036% பரிணாம மாறுபாட்டையும் காட்டியது. இது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணியாக DREB மரபணுவின் திறனை மேம்படுத்தியிருக்கலாம் மற்றும் வறட்சியின் போது சாகுபடியின் சிறந்த தத்தெடுப்பு மற்றும் சகிப்புத்தன்மையை வழங்க வழிவகுக்கும்.