ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

ஜாரியா நிலக்கரி படுகைப் படுகையில் மெத்தனோஜெனீசிஸின் இடைவெளியைக் குறைக்கும் சின்ட்ரோபிக்ஸ்

பிரியங்கா ஜா1,5*, சுஜித் கோஷ்1,2 $, குணால் முகோபாத்யாய்1, ஆஷிஷ் சச்சன்1 மற்றும் அம்பரீஷ் எஸ் வித்யார்த்தி 3,4

இந்தியாவில் CBM இன் மிகப்பெரிய உற்பத்தியாளரான ஜார்கண்டின் ஜாரியா படுகையில் இருந்து பிடுமினஸ் மற்றும் சப்-பிட்மினஸ் ரேங்க் நிலக்கரி உற்பத்தி செய்யப்படுகிறது. ஜாரியாவிலிருந்து மெத்தனோஜெனீசிஸ் குறித்து பல அறிக்கைகள் வந்தாலும், தற்போதைய ஆய்வு ஹைட்ரஜனோட்ரோபிக் மெத்தனோஜெனீசிஸுக்கு வினையூக்கியாக செயல்படக்கூடிய சின்ட்ரோபிக் நுண்ணுயிரிகளுக்கு சிறப்பு முக்கியத்துவம் கொடுக்கிறது. 454 பைரோ சீக்வென்சிங் மூலம் மெட்டஜெனோமிக் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி, ஜாரியா நிலக்கரிப் படுகையின் நீர் மாதிரிகள் மூலம் சின்ட்ரோபிக் சமூகத்தின் இருப்பு முதல் முறையாக புரிந்துகொள்ளப்பட்டது. MG-RAST சேவையகம் மூலம் GenBank தரவுத்தளத்திற்கு எதிராக BLASTX ஐப் பயன்படுத்தி இணைக்கப்படாத சுத்தமான மெட்டஜெனோமிக் வரிசைகளின் வகைபிரித்தல் ஒதுக்கீடு செய்யப்பட்டது. க்ளோஸ்ட்ரிடியா கிளாஸ் சின்ட்ரோபோமோனாடேசி குடும்பத்திற்கும், டெல்டாப்ரோட்டியோபாக்டீரியா குடும்பத்திற்கும் டெசல்போபாக்டீரேசி, பெலோபாக்டீரேசி, சின்ட்ரோஃபேசி மற்றும் சின்ட்ரோபோபாக்டீரேசி குடும்பத்திற்கும் தொடர் தொடர்பை வெளிப்படுத்தியது. சின்ட்ரோபோதெர்மஸ் இனத்துடன் தொடர்புடைய சின்ட்ரோஃப்கள் இருப்பதால் நிலக்கரி படுக்கையில் தெர்மோபயோஜெனிக் மெத்தனோஜெனீசிஸின் சாத்தியத்தை முடிவுகள் வெளிப்படுத்தின. இத்தகைய சமூகங்களின் இருப்பு நிலக்கரியை மீத்தேனாக உயிரிமாற்றம் செய்து ஆற்றல் உற்பத்தியை அதிகரிக்க உதவுகிறது.