ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

மல்பெரியின் முழுமையான மைட்டோகாண்ட்ரியல் ஜீனோம் வரிசை மாறுபாடு மற்றும் பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு

குவோ லியாங்லியாங், ஷி யிசு, வு மெங்மெங், மைக்கேல் அக்கா, கியாங் லின், வெய்குவோ ஜாவோ*

பின்னணி: மல்பெரி ஒரு பொருளாதார முக்கியத்துவம் வாய்ந்த பயிர், பல்வேறு சுற்றுச்சூழல் நிலைமைகளுக்கு சகிப்புத்தன்மை. இந்த ஆலை (இலைகள்) பட்டுப்புழுவிற்கு உணவளிக்கவும், அதன் இயற்கையை ரசிப்பதற்கும் பயன்படுத்தப்படுகிறது மற்றும் அதிக வளர்ச்சி வாய்ப்புகள் மற்றும் அறிவியல் ஆராய்ச்சி மதிப்பைக் கொண்டுள்ளது. மைட்டோகாண்ட்ரியா என்பது தாவரங்களின் ஆற்றல் மையமாகும், இது வாழ்க்கை செயல்முறைகளை மேற்கொள்ள தேவையான ஆற்றலை உற்பத்தி செய்கிறது.

குறிக்கோள்: தாவர மைட்டோகாண்ட்ரியா (எம்டி) மரபணு தாவரங்களில் வாழ்க்கை செயல்முறைகளை மேற்கொள்ள தேவையான ஆற்றலை உற்பத்தி செய்யும் ஆற்றல் மையமாக செயல்படுகிறது. இருப்பினும், மல்பெரி தாவரத்தின் மைட்டோகாண்ட்ரியா (எம்டி) மரபணு இன்னும் ஆராயப்படவில்லை. இந்த ஆய்வு மோரஸ் எல் ( எம். அட்ரோபுர்புரியா மற்றும் எம். மல்டிகாலிஸ் ) இன் எம்டி மரபணுவை ஆராய்ந்து மற்ற தாவர இனங்களுடன் ஒப்பிட்டது.

முறைகள்: Morus L இன் mt மரபணுவானது ( M. atropurpurea and M. multicaulis ) Oxford Nanopore Prometh ION ஐப் பயன்படுத்தி வரிசைப்படுத்தப்பட்டு தரவுகள் ஒருங்கிணைக்கப்பட்டு பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்டு பின்னர் மற்ற தாவரங்களின் மைட்டோகாண்ட்ரியன் மரபணுவுடன் ஒப்பிடப்பட்டது. ஆய்வு செய்யப்பட்ட மல்பெரி தாவரங்களின் பரிணாம நிலையை ஆய்வு செய்ய பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு மேற்கொள்ளப்பட்டது

முடிவுகள்: M. மல்டிகாலிஸின் வட்ட வடிவ mt மரபணு 361,546 bp நீளத்தைக் கொண்டுள்ளது, இதில் 54 மரபணுக்கள் உள்ளன, இதில் 31 புரத-குறியீட்டு மரபணுக்கள், 20 tRNA மரபணுக்கள் மற்றும் 3 rRNA மரபணுக்கள் மற்றும் A (27.38%), T (27.20%) ஆகியவற்றின் கலவையும் அடங்கும். , C (22.63%) மற்றும் G (22.79%). கையில், M. அட்ரோபுர்புரியாவின் வட்ட mt மரபணுவானது 395,412 bp நீளம் கொண்டது, இதில் C+G (45.50%) உள்ளது, இதில் 2 rRNA மரபணுக்கள், 22 tRNA மரபணுக்கள் மற்றும் 32 PCGகள் அடங்கிய 57 செயல்பாட்டு மரபணுக்கள் உள்ளன. எம். மல்டிகாலிஸ் மற்றும் எம். அட்ரோபுர்புரியா எம்டி மரபணுவில் வரிசைமுறை மறுநிகழ்வுகள், ஆர்என்ஏ எடிட்டிங் மரபணு மற்றும் சிபியிலிருந்து எம்டிக்கு இடம்பெயர்தல் ஆகியவை உள்ளன .

மோரஸ் மற்றும் பிற 28 இனங்களின் முழுமையான எம்டி மரபணுக்களின் அடிப்படையில் பைலோஜெனடிக் பகுப்பாய்வு சரியான பரிணாம மற்றும் வகைபிரித்தல் நிலையை பிரதிபலிக்கிறது.

முடிவு: M. M. மல்டிகாலிஸ் 361,546 bp நீளம் கொண்ட மோரஸ் இனம் mt மரபணு வட்டமானது என்பதைக் கண்டறிந்தோம் . 31 புரத-குறியீட்டு மரபணுக்கள், 20 tRNA மரபணுக்கள் மற்றும் 3 rRNA மரபணுக்கள் உட்பட 54 மரபணுக்கள். மேலும், எம். அட்ரோபுர்புரியாவின் நீளம் 395,412 பிபி என கண்டறியப்பட்டது. மேலும், மொத்தம் 57 மரபணுக்களில் 32 புரத-குறியீட்டு மரபணுக்கள் உள்ளன, 22 tRNA மற்றும் 3 rRNA ஆகியவை மரபணுவில் சிறுகுறிப்பு செய்யப்பட்டன. முடிவுகள் மோரஸ் எம்டி மரபணு பற்றிய விரிவான புரிதலை வழங்கும் மற்றும் எதிர்கால ஆய்வுகள் மற்றும் மல்பெரி வகைகளை இனப்பெருக்கம் செய்ய உதவும்.