ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

நிகழ்நேர அளவு பாலிமரேஸ் சங்கிலி எதிர்வினையைப் பயன்படுத்தி பயோமார்க் மற்றும் பயோசென்சராக பிளாஸ்டோமின் சாத்தியமான பங்கு

அமிதா பாண்டே*, ஷிஃபா சவுத்ரி, பினு பட்

பிளாஸ்டிடுகள் ஒளிச்சேர்க்கை, ஆற்றல் உருவாக்கம், வளர்ச்சி, மன அழுத்தத்தை உணர்தல், சேமிப்பு, பூக்கள் மற்றும் பழங்கள் பழுக்க வைப்பது உள்ளிட்ட பல முக்கியமான மற்றும் முக்கியமான செயல்பாடுகளைச் செய்யும் தாவரங்களுக்கு குறிப்பிட்ட அரை தன்னாட்சி யூகாரியோடிக் உறுப்புகளாகும். குளோரோபிளாஸ்டின் எண்ணிக்கை, பிளாஸ்டிட் துணை வகை உயிரியல் மற்றும் அபியோடிக் அழுத்தங்களால் பாதிக்கப்படுகிறது மற்றும் பிளாஸ்டோம் நகல் எண் (பிசிஎன்), பிளாஸ்டிட்களில் இருக்கும் வட்ட டிஎன்ஏ மூலக்கூறுகள் வளர்ச்சி நிலை மற்றும் சுற்றுச்சூழல் தூண்டுதல்களால் கட்டுப்படுத்தப்படுகின்றன என்று ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன. இந்த ஆய்வு முதன்முறையாக PCN ஐ பயோமார்க்கர் மற்றும் பயோசென்சராகப் பயன்படுத்த முன்மொழிகிறது, இதன் அடிப்படையில் இரண்டு வருட காலப்பகுதியில் பிளாஸ்டிட் டிஆர்என்ஏ குறிப்பிட்ட ப்ரைமர்களைப் பயன்படுத்தி, பருத்தியின் பருத்தி மற்றும் விதை மாதிரிகள், அரிசி, சோயாபீன், சோளம், மற்றும் எள். PCN ஐப் பயன்படுத்தலாம், ஏனெனில் அணுக்கரு டிஎன்ஏக்கு மாறாக PCN உள் மற்றும் வெளிப்புற காரணிகளால் மாற்றியமைக்கப்படுகிறது, இந்த முறைக்கு பிளாஸ்டோம் வரிசை பற்றிய முன் அறிவு தேவையில்லை, ஏனெனில் பயன்படுத்தப்படும் ப்ரைமர்கள் அனைத்து தாவர வகைகளின் பிளாஸ்டோமை இலக்காகக் கொண்ட உலகளாவிய ப்ரைமர்கள், PCN அணுக்கருவை விட அதிகமாக உள்ளது, மேலும் PCN ஐ qPCR மதிப்பீடுகள் மூலம் விரைவாக தீர்மானிக்க முடியும். சராசரி Ct மதிப்புகள், சராசரி பதிவு PCN மதிப்புகள் மற்றும் பருத்தி விதை மற்றும் பருத்தியின் raw ஆகியவற்றின் பதிவு PCN மதிப்புகள் ஆகியவற்றின் பகுப்பாய்வு, பருத்தியின் மாதிரிகளைக் கொண்ட விதைகள், இரண்டு வருட காலத்திற்குள் பல்வேறு ஆதாரங்களில் இருந்து பதப்படுத்தப்பட்ட மற்றும் பெறப்பட்ட மாதிரிகள் PCN ஆகும். 4 பிளாஸ்டோம்கள் வரையிலான வித்தியாசத்தைக் காட்டும் குழுவிற்குள் மிகவும் மாறாதது, அதாவது வெவ்வேறு மாதிரிகளுக்கு இடையில் 0.58 பதிவு, PCN இன் சாத்தியமான பயன்பாட்டைக் குறிக்கிறது தாவர இனத்தை நிர்ணயிப்பதற்கான உயிர் குறிப்பான். மேலும், அதிக சராசரி PCN (பதிவு 3.86) மற்றும் குறைந்த வரம்பு PCN (பதிவு 0.05) உடன் ஒப்பிடும்போது உடைந்த உமி நீக்கப்பட்ட அரிசி (RS)க்கான குறைந்த சராசரி PCN (பதிவு 2.9) மற்றும் அதிக வரம்பு PCN (பதிவு 3.09) ஆகியவற்றைக் கவனித்தல். ), அறுவடைக்குப் பிந்தைய செயலாக்கம் மற்றும் சேமிப்பின் போது நெல் விதையைப் பாதுகாக்கும் போது, ​​PCN விதையின் தரத்தின் குறிகாட்டியாக இருக்கும் என்று பரிந்துரைக்கிறது. அஜியோடிக் காரணிகளால் பிசிஎன் மாற்றியமைக்கப்படலாம் என்ற எங்கள் அனுமானத்தை ஆதரிக்க, அரிசி விதைகள் அதிக வெப்பநிலை மற்றும் ஈரப்பதத்துடன் சிகிச்சையளிக்கப்படுகின்றன, அதிக வெப்பநிலைக்கு வெளிப்படும் விதைகள், சிகிச்சையளிக்கப்படாத விதைகளுடன் ஒப்பிடும்போது அதிக சராசரி Ct மதிப்புகளை வெளிப்படுத்தியது, இது PCN இன் குறைவைக் குறிக்கிறது. முடிவில், பிசிஎன் ஒரு பயோமார்க்கராகவும் பயோசென்சராகவும் பயன்படுத்தப்படலாம்.