ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

2டி விநியோகங்களில் ஜீனோம்களின் சமச்சீர் பண்புகளைக் கண்டறிய மாறுபாடு வரைபடக் கட்டுமானம்

ஜெஃப்ரி ஜெங், வெய்கியோங் ஜாங், ஜின் லுவோ3, வெய் ஜௌ1 மற்றும் வெரோனிகா லீசாபுத்ரா

மனித ஜீனோம் திட்டத்தில் காட்சிப்படுத்தல் முறைகள் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன. ENCODE போன்ற பிற சர்வதேச திட்டங்களில் மேலும் வளர்ச்சிக்குப் பிறகு, அதிக எண்ணிக்கையிலான ஜீனோம் தரவுத்தளங்கள் நிறுவப்பட்டு, வெகுஜன மரபணு அளவிலான மரபணு வெளிப்பாடு அளவீடுகள் உருவாக்கப்படுகின்றன. தற்போதைய சூழ்நிலையில், கணக்கீட்டு செல் உயிரியலில் இலக்குகளை வரிசையான தரவுகளை சேகரிப்பதில் இருந்து உயர்-நிலை விளக்கத்தை உருவாக்குதல் மற்றும் மரபணுக்களுக்கான திறமையான உள்ளடக்க அடிப்படையிலான மீட்டெடுப்பு பொறிமுறையை ஆராய்வது அவசியம். பாலூட்டிகளின் மரபணுக்கள் ஆயிரக்கணக்கான பெரிய குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏக்களை (எல்என்சிஆர்என்ஏக்கள்) குறியாக்குகின்றன, அவற்றில் பல மரபணு வெளிப்பாட்டைக் கட்டுப்படுத்துகின்றன, குரோமாடின் ஒழுங்குமுறை வளாகங்களுடன் தொடர்பு கொள்கின்றன, மேலும் மரபணு முழுவதும் உள்ள இடங்களை இலக்காகக் கொண்டு இந்த வளாகங்களை உள்ளூர்மயமாக்குவதில் பங்கு வகிக்கின்றன. உயர் பரிமாண காட்சிப்படுத்தல் கருவிகளைப் பயன்படுத்தி, அவற்றின் சிக்கலான ஊடாடும் பண்புகளை வெவ்வேறு காட்சி வரைபடங்களாக ஒழுங்கமைக்க முடியும். டிஎன்ஏ அல்லது ஆர்என்ஏ பிரதிநிதித்துவங்களைப் போலவே நான்கு மெட்டா சின்னங்களைப் பயன்படுத்தும் பல வரைபடங்களைப் பயன்படுத்துவதற்கு, வளர்ந்து வரும் திட்டமாக மாறுபாடு வரைபடக் கட்டுமான விஎம்சி முறையாக இந்த தாளில் முன்மொழியப்பட்டுள்ளது. முக்கிய கூறுகளின் கணினி கட்டமைப்பு மற்றும் VMC இல் உள்ள முக்கிய பொறிமுறை ஆகியவை விவரிக்கப்பட்டுள்ளன. முக்கிய தொகுதிகள், தொடர்புடைய சமன்பாடுகள் மற்றும் அவற்றின் I/O அளவுருக்கள் விவாதிக்கப்படுகின்றன. VMC அமைப்பைப் பயன்படுத்தி, 2D வரைபடங்களில் தொடர்புடைய DNA வரிசைகளுக்கு இடையே உள்ள உயர் மட்ட உள்ளார்ந்த உறவுகளில் அவற்றின் புலப்படும் பண்புகளைக் காட்ட, பல உண்மையான காட்சிகளின் இரண்டு DNA தரவுத் தொகுப்புகள் சோதிக்கப்படுகின்றன. மாறுபட்ட வரைபடக் கட்டுமானத்தின் 2D வரைபடங்களின் கீழ் தொடர்புடைய மரபணு வரிசைகளில் அவற்றின் உள்ளார்ந்த பண்புகள் மற்றும் சமச்சீர் பண்புகளை ஆராய காட்சி முடிவுகள் சுருக்கமாக பகுப்பாய்வு செய்யப்படுகின்றன. மாதிரி 2டி வரைபடங்களின் தொகுப்பு சேர்க்கப்பட்டுள்ளது மற்றும் அவற்றின் பண்புகள் பல்வேறு கட்டுப்படுத்தக்கூடிய சூழலில் விளக்கப்பட்டுள்ளன.