ஜர்னல் ஆஃப் டேட்டா மைனிங் இன் ஜெனோமிக்ஸ் & புரோட்டியோமிக்ஸ்

சுருக்கம்

பூச்சிகளின் முழு-புரோட்டீம் மரம்: ஒரு தகவல்-கோட்பாட்டின் அடிப்படையிலான "சீரமைப்பு-இலவச" பைலோஜெனி மற்றும் "புரோட்டியோம் புத்தகங்களின்" குழுவாக

ஜேஜின் சோய், பியுங்-ஜு கிம், சுங்-ஹூ கிம்

பின்னணி: பூச்சிகளின் "உயிரின மரம்", அனைத்து உயிரினங்களின் மிகப்பெரிய மற்றும் மிகவும் இனங்கள்-பல்வேறு குழு, தற்போதுள்ள பூச்சிகளின் சிக்கலான மற்றும் கணிக்க முடியாத பரிணாம வளர்ச்சியின் எளிமைப்படுத்தப்பட்ட கதையைப் பிடிக்க ஒரு உருவக மற்றும் கருத்தியல் மரமாக கருதலாம். தற்போது, ​​மிகவும் பொதுவான அணுகுமுறையானது, ஒவ்வொரு உயிரினத்தையும் பிரதிநிதித்துவப்படுத்த, தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட மரபணுக்கள்/புரதங்கள் ஒவ்வொன்றின் மிகவும் சீரமைக்கக்கூடிய பகுதிகளின் குழுவைத் தேர்ந்தெடுப்பதன் மூலம், உயிரின மரத்திற்கான பினாமியாக "மரபணு மரத்தை" உருவாக்குவதாகும். இருப்பினும், அத்தகைய தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட பகுதிகள் அனைத்து மரபணுக்கள் / புரதங்களின் ஒரு சிறிய பகுதியையும், ஒரு உயிரினத்தின் முழு மரபணுவின் சிறிய பகுதியையும் கணக்கிடுகின்றன. கடந்த தசாப்தங்களில், தற்போதுள்ள பல பூச்சிகளின் முழு-மரபணு வரிசைகள் கிடைத்தன, இது வரிசை சீரமைப்பு (சீரமைப்பு-இலவச முறை) இல்லாமல் தகவல் கோட்பாட்டைப் பயன்படுத்தி பூச்சிகளின் "முழு-மரபணு அல்லது முழு-புரோட்டீம் மரத்தை" உருவாக்குவதற்கான வாய்ப்பை வழங்குகிறது.

முடிவுகள்: பூச்சிகளின் முழு-புரோட்டீம் மரம் (அ) மக்கள்தொகைக் குழு-முறை மரபணு மரங்களில் உள்ளதைப் போன்றது என்பதைக் காட்டுகிறது, ஆனால் குழுக்களின் கிளை வரிசைகளில் குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகள் உள்ளன, இதனால், ஜோடிகளுக்கு இடையிலான சகோதர உறவுகள் குழுக்கள்; மற்றும் (b) முக்கிய குழுக்களின் அனைத்து நிறுவனர்களும் மரத்தின் வேருக்கு அருகில் ஒரு "வெடிப்பு வெடிப்பில்" வெளிவந்துள்ளனர்.

முடிவு: ஒரு உயிரினத்தின் முழு-புரோட்டீம் வரிசையும் அமினோ-அமில எழுத்துக்களின் "புத்தகமாக" கருதப்படுவதால், தகவல் கோட்பாட்டின் உரை பகுப்பாய்வு முறையைப் பயன்படுத்தி, தொடர்களை சீரமைக்காமல், புத்தகங்களின் மரத்தை உருவாக்க முடியும். இத்தகைய மரம் தற்போதுள்ள பூச்சிகளுக்கு இடையே பரிணாமம் மற்றும் உறவின் கதையை உருவாக்குவதற்கான மாற்றுக் கண்ணோட்டத்தை வழங்குகிறது.